一些常见生物实验小技巧

上一篇 / 下一篇  2012-05-04 17:15:33

  SDS-PAGE

  1. SDS-PAGE配制过程中,浓缩胶与分离胶可预先配好大体积(如100ml)预制胶,储存在4度冰箱(注:10% APS,TEMED不加),每次配置时只需吸取所需体积的预制胶加入相应体积APS,TEMED即可,预制胶可储存半年以上,能节省很多时间,更重要的是,可大大减少与丙稀酰胺的接触,减少中毒。。

  2. 配胶过程中,普通的SDS-PAGE中加入约13%的甘油,可以提高分辨率,有效防止小分子量蛋白的弥散。改进过程只需将配方中的水改成60%的甘油即可。。

  3. 配好后,若过夜使用,待凝聚后不要拔下梳子,把含胶玻璃板从制胶槽取下,注意玻璃板上下两边缘会有气体,所以需要加一点电泳缓冲液以避免胶内水分蒸发,用保鲜膜包上,然后放4度过夜,第二天在电泳槽内直接拔下梳子即可使用。

  4. 分离胶用水压胶不平时,可以换用乙醇(浓度无要求,干净即可),效果较好。

  5. 配置分离胶时因胶凝时收缩常导致加样孔变浅,可以将加剩的胶放入4℃以降低凝聚速度,而将凝胶放入37度促聚,并随时用4℃加剩的胶补充下降的胶面;另外将胶横放与水平面成10度角也可以减少收缩的影响。

  6. 丙烯酰胺放置时间过长(超过一年),会吸水潮解,导致胶不凝。。

  7. 凝胶时温度高凝胶快,但过高时,会影响交连物的孔径大小,25℃为宜。

  8. 氧气是胶凝固的终止剂,所以尽量避免胶中气泡出现。。

  9. 大肠表达检测时,一般要煮样,但煮出来时常较稠,用8M尿素重悬细胞后再煮效果较好。

  10. 配好的10×TBE经过高压灭菌后,不会形成沉淀,可以用很长时间,而且跑出的条带也很漂亮。

  11. 上样时,最后保证上样量一样,包括体积,当体积不同时,可以加缓冲液补全,这样跑出的胶较为一致。所有的加样孔都加样,可以防止边缘的样品拖尾,如样品不多,其余的孔均用上样缓冲液加满,防止影响条带扩散。

  12. 跑胶时,因为低电压跑会避免高电压产生的热量尔导致的胶层变形,所以低电压泳道会比高电压泳道跑的直一些,且分离效果更高,有利于分子量相差不大的蛋白分离。。

  13. 跑胶过程中,为节省时间,可以提高电压,但得注意散热,可以冰浴跑胶,将电泳槽放入盛有冰水的盆中,或是冰箱中,节省的时间的同时,效果也较好。。

  14. 防止条带跑歪:分离胶配好后4度过夜;在点样的时候紧靠于上样两边的点样孔各上20微上样缓冲液。

  15. 电泳完撬胶时根本不需要用撬胶板,用流水冲玻璃板的缝隙处(也就是凝胶部分),一边冲一边轻轻掀起玻板,用水去充满玻板和胶之间的缝隙,很容易能把玻板掀开。接下来把玻板反过来,让胶面朝下,使其一端浸入到一个盛着水的大平皿中,轻轻晃动,胶很快就会被水带到平皿中了,丝毫不会损伤胶。。

  16. 染色时,为节省染色时间,可以先将染色液在微波炉内加热5-10秒,不能太久,避免冰醋酸挥发,然后在水平摇床上放置半个小时即可染色好。如果是旧染色液,隔十分钟加热一次。。

  17. 脱色时,可不用脱色液,直接用去离子水,放微波炉中高火里煮沸5分钟左右,然后将水倒掉,再换上新的去离子水煮,这样反复几次即可。效果可能比正常的脱色稍差一点点,不如那样清楚,只要电泳时比平时多上1/5的样品就可以了,关键是这样省时省材料(用不着含甲醇和冰醋酸的脱色液)。。

  18. 用硝酸银染色,那么显色时如果迟迟不出现条带,可以再显色夜里加一点甲醛。如果染色或显色没有做好,染成了海带胶,我们可以复染。将胶用一蒸水清洗7.8遍,再重新染色,显色。

  质粒提取

  1. 质粒提取时,最后一步的酒精挥发对后续酶切等至关重要,尽量延长挥发时间,最好是在空调的热风中挥发。

  2. 加速燥的方法,70%乙醇清洗过后,再加无水乙醇清洗再倒掉无水乙醇,加速挥发。。

  3. 利用试剂盒中硅胶柱手提质粒,手提质粒时,配置的溶液一、溶液二、溶液三(代替试剂盒的solution1、2、3),然后一比一的与饱和碘化钾或碘化钠(代替结合缓冲液)混合,就可以让质粒在硅胶上结合,而只要是一样的质粒,试剂盒的硅胶柱可以重复使用,没有试剂盒溶液量的限制。。

  4. 质粒提取的最后一步用TE(水)洗硅胶时,一般是加水后放置一分钟,再离心收集DNA。可以加水后当即离心,再次把离心收集的液体重新加到硅胶柱上,放置一分钟,离心,这样得到的质粒的回收率要高出10~30%,另外,同一种质粒,用过的柱子可以反复使用(5次)。 。

  Western Blot

  1. Western Blot在摸索一抗、二抗浓度,封闭时间,曝光时间等条件时,可以一次转膜后,将膜晾干,裁减成小块保存,每次取一小块进行条件摸索,可以避免每次都重新跑胶、转膜甚至是重新提取蛋白,可以节省大量时间。

  2. Western Blot时,转膜后暂存晾干的膜于4℃条件下比将蛋白保存在Buffer中更可靠。。

  溶液配制

  1. 培养基试剂等配制过程中可先将各成分配成母液,并在常用试剂瓶上写上该试剂配方,方便配制。

  2. 剧毒物质配制过程中,以往是先根据要配的浓度与所需体积算好待称物质的量,其实可以先称好有毒物质,再去调整溶剂的体积,以避免长时间与有毒物质接触。。

  PCR、酶切、连接并进行凝胶检测。

  1. PCR,酶切时,可以将反应液除模板,引物,酶的其他成分配预混合制成Mix形式,储贮在-20℃冰箱中,用时取出分装,可以避免每次条件不均。。

  2. 菌落或菌液直接PCR时,预变性的时间延长至5min,效果较好。

  3. PCR 的循环参数的第一步都是94或95度预热3~5分钟,延伸一般都是72℃,按照这些参数做PCR一般都可以做出来,但在长片段PCR(>2kb) 中,由于DNA模板在94℃高温20秒以上就会发生脱嘌呤反应,当taq酶遇到模板上的这些错误时就会停下来从而使反应不能继续进行,时间越长,模板损坏也越严重,得不到产物的可能性也越大,另外,对于我们实验中用到的许多taq酶来说,72℃并不是其最佳的反应温度。如Takara LA酶的最适反应温度是68℃,采用92℃预热3分钟,95℃变性15-20秒,退火后于68℃延伸取得很好的效果,扩过最长的片段为10kb。。

  4. 双酶切时,两个酶单独酶切效果要好很多。在第一个酶切完成后,将体系热失活(根据说明书,一般65℃,20min),再进行第二个酶切。。

  5. 提高酶切效率的方法,将要进行酶切的质粒DNA直接放于95℃的水浴锅中10 s,取出自然放冷,再加样进行酶切。

  6. 高GC含量的酶切位点如NotI,应该用甲基化缺陷的宿主菌如E.coli Top10等。

  7. 用酶切作检测时,在微波炉里面加热1min即可跑胶检测,双酶切可以考虑2min,但酶切不够充分,回收量可能不够。

  8. 琼脂糖凝胶跑完后可以二次点样。。

  9. 跑胶过程中,先100V电压跑约15min,再将电压调大至120-130V,进行较小差异电泳,可以避免大片段残存在胶孔不动的情况,跑出来的带较为漂亮且省时。。

  10. 做连接时,连接buffer一定要避免反复冻融,可在第一次用时就分装成小份,三次以上冻融会大大降低连接效率。

  RNA提取与检测

  1. RNA电泳过程中,预电泳5-10min 减少了非特异RNA条带的出现,有利于分离和纯化,同时可根据电泳仪是否冒泡判断电泳仪装置是否有误。。

  2. RNA 点样过程中,样品是在电泳缓冲液液略低于胶表面而不是在高过胶面时加进齿槽,避免了加样时RNA 的扩散、加样后RNA 从齿槽逸出造成RNA的弥散及定位不良等现象。电3-5min 让RNA进入凝胶后再加电泳缓冲液液高过表面,确保了加到每个槽中的RNA量及定位的准确性,从而有利于RNA的鉴定和纯化。(亦适合于DNA)。

  其他

  1. 超滤对于按照分子量进行初分离的效果不是很好,但很适合用于蛋白的浓缩,更换缓冲液和除盐。

  2. 蛋白质纯化时,蛋白质降解可能与超声破菌保持冰浴有关,之前建议加PMSF(剧毒,蛋白降解抑制剂),建议在上柱子洗脱的时候也加PMSF,一定要用之前再加。。

  3. 垂直电泳时,可在电泳糟中放入青霉素小瓶等,可使液面提高而不影响电泳,又很节约电泳缓冲液。

  4. 柱层析时,如果样品较多,可以将样放在三角瓶中,用一个输液管与柱上端连通,并持平,用枪头引导液体流出,调好流速。。

  5. 细胞培养过程中,传代时,不用吹打或刮落,先将上清吸出,适当拍打培养瓶,即可见贴壁细胞脱落,加培养基混悬即可。

  6. 96孔板上气泡的去除方便快捷的方法,用吹风机直接对着板用热风吹,1~2s见效。

  7. 倒制平板时,避免皿盖上的水汽的方法,在倒制培养基平板时,将倒制的平板迅速的摞在一起;如果条件允许,可以在最上面放置一个倒有半培养皿热水的培养皿,静置至平板培养基凝固完全。。

  19. 脱色时用0.25M NaCl代替脱色液,效果较好,无毒。。

  20. 脱色时,在脱色液中加入娄张捏成条状的擦镜纸或是面巾纸,由于染料吸附到纸纤维上,可以加速脱色,待纸着色较深时,更换新纸条,不用换液。。


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Doctorcbw 引用 删除 Doctorcbw   /   2012-05-05 13:47:58
文章非常好,谢谢分享
 

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