海绵基因组被测序

上一篇 / 下一篇  2010-08-07 10:20:00 / 个人分类:实验方法

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海绵基因被测序

“The Amphimedon queenslandica genome and the evolution of animal complexity”

nature 给了一个ARTICLES,8页。说明这个基因组有很大的意义。

对了解动物的演化有着重要的意义,现在认为它是在动物的基部,

在发育与转录调控层面有着重要的意义,比如一些发育信号在动物中是怎么演化,通过看看在动物的基部可能会有有意思的发现。同时对很多转录因子的比较分析也会发现有意思的现象,比如海绵缺少Hox genes和一些其他转录因子的亚家族。

这里面有个比较有意思的例子,是整合素(integrin)的进化分析,先前的一篇PNAS就在动物之外发现了整合素,而在海绵中同样发现了整合 素。也就是通过比较海绵,还有choanoflagellate Monosiga brevicollis能发现一些在动物中早期就有的一些信号通路。 现在有了海绵的基因组序列就相当于有了一个连接的桥,通过这个桥就能走过去看些一些有意思的东西,比如pathway,proteins complex,gene,gene family and so on.

海绵基因组出来估计在近一段时间会有很多文章跟着出来,也就是基于这个基因组能做很多的工作(特别是进化分析),我看的时候心里也痒痒的,也想跟着做些工作,但对于生物的知识了解太少,很难提出一些问题,分析方面(技术)到不成问题。呵呵, 谁有兴趣,讨论下??      分析化学  仪器分析  红外光谱

 

 

Amphimedon genome

 

 

Integrin PNAS

TAG: 海绵基因组

 

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