海绵基因组被测序

海绵基因组被测序

“The Amphimedon queenslandica genome and the evolution of animal complexity”

nature 给了一个ARTICLES，8页。说明这个基因组有很大的意义。

对了解动物的演化有着重要的意义，现在认为它是在动物的基部，

在发育与转录调控层面有着重要的意义，比如一些发育信号在动物中是怎么演化，通过看看在动物的基部可能会有有意思的发现。同时对很多转录因子的比较分析也会发现有意思的现象，比如海绵缺少Hox genes和一些其他转录因子的亚家族。

这里面有个比较有意思的例子，是整合素（integrin）的进化分析，先前的一篇PNAS就在动物之外发现了整合素，而在海绵中同样发现了整合 素。也就是通过比较海绵，还有choanoflagellate Monosiga brevicollis能发现一些在动物中早期就有的一些信号通路。 现在有了海绵的基因组序列就相当于有了一个连接的桥，通过这个桥就能走过去看些一些有意思的东西，比如pathway，proteins complex，gene，gene family and so on.

海绵基因组出来估计在近一段时间会有很多文章跟着出来，也就是基于这个基因组能做很多的工作（特别是进化分析），我看的时候心里也痒痒的，也想跟着做些工作，但对于生物的知识了解太少，很难提出一些问题，分析方面（技术）到不成问题。呵呵， 谁有兴趣，讨论下？？       分析化学  仪器分析  红外光谱

 

 

Amphimedon genome

 

 

Integrin PNAS