肠出血性大肠杆菌基因组草图公布

上一篇 / 下一篇  2011-07-25 14:09:12

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  据美国物理学家组织网报道,德国明斯特大学和美国生命技术公司的研究人员刚刚公布了肠出血性大肠杆菌(EHEC)的基因组草图。研究人员称,该草图的公布不但有助于人们对近几个月来在德国等多个国家暴发的EHEC疫情进行监控,还可能带来更为有效的治疗方法。相关研究成果7月20日发表在《公共科学图书馆—综合》(PLoS One)杂志在线版上。

  明斯特大学卫生研究所溶血性尿毒综合征实验室博士亚历山大·迈尔曼说,通过将引发此次疫情的O104:H4型肠出血性大肠杆菌与2001年采集自一名溶血性尿毒症(HUS)体内的O104:H4型肠出血性大肠杆菌进行基因对比后,他们发现,两种菌株并非同源,引起此次德国EHEC暴发的O104:H4菌株来自一种肠聚集性大肠杆菌EAEC O104:H4 55989菌株的变异,其中还掺杂了一种目前未知的由志贺毒素产生的O104:H4菌株。

  论文作者、明斯特大学卫生研究所教授赫希·卡赫说,这项研究再次强调了积累的重要作用。从1996年起他们就开始了溶血性尿毒症症候群等疾病的研究和生物样本的采集工作,此前的研究对发现高致病性EHEC菌株的变异非常重要。

  负责该研究的明斯特大学微生物学家达格·哈马舍尔教授说:“多亏有了离子流个人化操作基因组测序仪(PGM)和新一代测序技术(NGS)的帮助,测序工作才能进行得如此迅速。虽然此前已有不少研究采用了新一代测序技术,但将其用于突发疫情的实时研究还尚属首次。”

  明斯特大学医学院院长威廉·施密茨说,如此快速的测序完全可以被称为一个“技术杰作”,其成果不但有助于对疫情的监测和诊断,还极有可能导致新疗法的产生。


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