C端测序

方法：串联质谱法

 

原理：即在质谱中获得蛋白质肽段的碎片。肽段在质谱中的碎裂有一定规律，通常最容易断裂的是肽键位置，得到分别命名为b离子和y离子，得到这些离子的M/Z的图谱，分析图谱得到的蛋白质的C端序列。

 

Finnigan LCQ Deca XP / Finnigan LTQ

 

含盐量： 挥发性无机盐<20mM；不挥发性无机盐<5mM

样品量：蛋白质总量>50pmol，纯度>90％

样品要已知氨基酸序列

 

某样品C端测序分析

理论的C端序列：GSCNXXCVSGCAGRC

 

图谱解析：根据以上图谱解析得到的样的C末端序列为：GSCNXXCVSGCAGRC

其中X代表某一氨基酸（保密）

 

1、  样品不纯

2、  样品量不够