蛋白质鉴定：shotgun 混合蛋白鉴定

原理：
针对液体或SDS-PAGE条带的复杂混合物用酶（Trypsin）酶解成肽段混合物，这些肽段混合物再通过液相色谱分离(如2DLC(阳离子柱SCX和C18反相柱串联)或1DLC 的C18反相柱)，再用串联质谱测试，然后在相应的数据库检索进行鉴定，可同时鉴定成百上千种蛋白质。

优点：与传统的2D-gel比，一般的说来，Shotgun方法的灵敏度要高
缺点：会丢失一部分翻译后修饰的信息
 
仪器： Finnigan LTQ

样品要求

1. 样品量>300μg，浓度>0.5mg/ml
2. 含盐量<50 mM
3. 注明样品制备的过程及所用的裂解液成分
4. 注明样品的组成成分（是否含脂类、色素、糖等）
5. 注明是否可以用沉淀、透析以及超滤等来除盐及杂质
 
客户发表的论文

• He P, He HZ, Dai J, Wang Y, Sheng QH, Zhou LP, Zhang ZS, Sun YL, Liu F, Wang K, Zhang JS, Wang HX, Song ZM, Zhang HR, Zeng R, Zhao X. The human plasma proteome: Analysis of Chinese serum using shotgun strategy. Proteomics. 2005, 5: 3442-53
• Lingbing Zhang, Yanni Lun, Dongmei Yan, Leyang Yu,Wei Ma, Bairong Du, Xun Zhu, Proteomic analysis of macrophages: A new way to identify novel cell-surface antigens. Journal of Immunological Methods 321 (2007) 80–85