DNA Repair:裂殖酵母采用多种末端连接法修复DNA损伤

上一篇 / 下一篇  2011-11-30 19:12:58

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作者:北京生命科学研究所 来源:北京生命科学研究所 2011-11-21 17:04:00

 

11月16日,DNA Repair在线发表了北京生命科学研究所研究员杜立林实验室的最新研究成果,首次报道了一个在裂殖酵母中检测染色体上进行的末端连接修复的方法,并利用此方法分析了机理不同的三类末端连接修复方式。

非同源末端连接(NHEJ)是哺乳动物中修复DNA双链断裂的主要方式。参与NHEJ的修复蛋白如Ku,ligase IV,XLF,和X家族DNA聚合酶在裂殖酵母中都是保守的。通过表达一个高特异性的核酸内切酶来产生基因组上一个特定位置的双链断裂,作者建立了结合传统测序和高通量测序全面分析不精确修复产物序列的方法,对突变体中修复产物序列的分析验证了Ku,ligase IV和XLF在经典NHEJ中的核心作用,以及X家族DNA聚合酶Pol4在间隙填补(Gap Filling)中的重要作用。研究发现在Ku或ligase IV缺失的突变体中,两种非NHEJ的另类末端连接仍能发生。其中一种方式利用了DNA断裂位置两侧的微同源(microhomology)序列并造成几百至几千碱基的缺失,另外一种方式则只在酶切位点处引入碱基置换。

本文的实验结果主要由北京大学、清华大学和北京生命科学研究所联合培养博士研究生项目(PTN-BBS)2011级研究生李鹏在轮转期间完成,其他贡献者有研究生李俊,李明,窦坤,和生物信息分析员张美俊和索芳。此项研究由科技部和北京市资助,在北京生命科学研究所完成。


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