SherlockMIS微生物菌种鉴定系统简介


Sherlock Microbiol Identification System(MIS)是由美国MIDI公司研究及行销市场,MIDI主要是用来分析及鉴定已分离且在人工培养基中纯化培养的微生物。Sherlock利用检体的前处理过程和气相色谱分析(GC Gas Chromatography)产生的定量脂肪酸形成成分描绘,与Sherlock菌种标准数据库比对,准确判断待检样品的菌种类型。

Sherlock可鉴定出广范围的微生物,分析前不需要分离筛检物理性及生物化学性的族群,每个资料库都收集了良好特征的菌种,经由微生物学家操作建议下的培养菌种,特别适合以下领域的研究和开发应用:

1. 环境科学

2. 医学/临床

3. 灭菌控制

4. 植物及土壤

5. 食品工程

6. 饮用水及废水处理工程

生物标志物biomarker)是微生物中含有的一些化学物质,其含量或结构具有种属特征及与其分布位置密切相关,能够标志某一类或某种特定微生物的存在。这些具有分类学变异的化学物质的种类和含量可以作为鉴定微生物的指标。生物标志物的种类很多,不饱和脂肪酸、蛋白质、核酸类脂、磷脂和多糖等。脂类是早被用于细菌鉴定的生物标志物,约始于20世纪60年代,在这方面的文献报道和许多种分析技术的应用中,脂类易于提取和浓缩,其结构的变化与病菌的营养和生理状况相关,在此情况下还可检测细菌的传染性,如霍乱弧菌脂类结构的变化可以指示细菌感染性的强弱。

检测脂类的手段主要是GC质谱。美国MIDI公司的Sherlock系统通过GC分析细菌脂肪酸的方法专门用于细菌的分类鉴定。

    细菌在标准的培养条件下培养和收获,经过有机溶剂萃取脂肪酸成分和甲酸化后,注入GC分析系统,一个分析周期2hr(细菌培养时间除外)

与传统的微生物鉴定手段如形态学观察、生化反应、免疫反应等检测手段比较,Sherlock利用GC分析脂肪酸的办法有下列优点:

※ 检测耗时较少:GC分析脂肪酸的方法,结果评价更具客观性,减少认为判断的误差。Sherlock通过将耗氧、厌氧及酵母菌在相应的温度、养料下培养一定时间(2448hr),抽提脂肪酸直接上样到GC ,全自动分析,操作简单。传统的方法现利用微生物对碳源代谢的利用率的方法,需先将菌分为革兰氏阳性及阴性菌,并判断球标菌(可能会误判),在分型培养后需多耗一天时间进行培养来得到细菌的碳源利用率,操作复杂,需有经验的试验人员。

※ 费用低廉:不需要专用的消耗品(如专用碳源代谢培养基)

※ 应用广泛:Sherlock数据库包括:

1. 耗氧菌库1148

2. 厌氧菌库800

以上两类合计1948种,而传统的鉴定方法耗氧为1000种左右

3. 酵母菌库(包含放线菌库)300

4. 防生物恐怖事件急库菌库21

包括炭疽热,鼠疫基因等6种主要传染性致病15

※ MIDI公司提供免费的资料库的升级。