多种方法分析斑马鱼(Danio rerio) 肝脏代谢谱

Ong ES, Chor CF, Zou L, Ong CN. Mol Biosyst. 2009 Mar; 5(3): 288-98. Epub 2008 Dec 24.

摘要:用多种平台方法,包括1H NMR、GC/MS 和LC/MS,对雄性和雌性斑马鱼(Danio rerio) 的肝脏生化谱进行了代谢组学研究。测定前验证了三种方法的重现性和可靠性。某种方法检测到的主要生物分子,再用其它方法进行交叉验证。这些代谢物包括用1H NMR 和GC/MS 测定的碳水化合物、脂类、氨基酸,用1H NMR 和LC/MS 测定的乙酰肉碱、胆碱和各种磷脂。我们的结果表明,1H NMR 能够提供了斑马鱼肝脏中葡萄糖、氨基酸、丙酸酯和其它小分子生化组分的全面信息。另外,GC/MS 适用于分析胆固醇、饱和和不饱和脂肪酸,而LC/MS 最适合分析脂类/磷脂。这些技术显示,雄性和雌性斑马鱼肝组织提取液的生化谱有明显差异。特别地,我们注意到虽然雄性和雌性斑马鱼肝脏的碳水化合物谱没有明显区别,但氨基酸谱差异却相当明显。另外,三种技术的数据表明,虽然饱和脂肪酸谱相似,但两种表型中不饱和脂肪酸谱却不同。上述结果提示,这种多平台方法可对代谢组进行全面检测,并为人们理解生物系统中差异性生化谱的意义提供了有价值的信息。