用分子式和METLIN 个人代谢物数据库匹配对LC/TOF-MS 得到的数据进行化合物鉴定

Sana TR, Roark JC, Li X, Waddell K, Fischer SM. J Biomol Tech. 2008 Sep; 19(4): 258-66.

摘要：为了简化从液相色谱-飞行时间质谱所得代谢组学数据中鉴定化合物的步骤，我们编写了构建个人代谢物数据库的软件，该数据库包含从公共METLIN 数据库(http://metlin.scripps.edu/) 中获取的15,000 多种化合物。此外，我们还为数据库增添了其它功能，如，(a) 用户可以在数据库中添加保留时间并将其作为独立的可检索参数，作为精确质量数检索的补充;(b) 可以外接独立的分子式生成软件(MFG)，为精确质量质谱数据与数据库的匹配提供可靠的解释。为了验证这一鉴定策略的实用性，我们将78 个合成尿标准品的保留时间添加到该数据库的子集中。然后对这些合成物的混合物进行分析并用上述METLIN 尿数据库筛查，结果有46 个的精确质量和保留时间都匹配。接下来，在同样条件下用该数据库对人体尿液样品进行了分析和筛查。人体尿液中共检测到1387 个离子;其中有16 个的精确质量数和保留时间与数据库相匹配。另有374 个只有精确质量数与数据库匹配，其中163个质量数的MFG 分值最高。另外，MFG 计算出了与数据库无法匹配的849 个离子的分子式。总体而言，这些结果表明METLIN个人代谢物数据库和MFG 软件为验证数据库匹配化合物的分子式提供了可靠的策略。对于数据库无法匹配的离子，也会提出可能的分子式，可能对实验结果的解释有所帮助。