酿酒酵母— 一种抗病毒药物筛选中优选宿主靶标的辅助工具— 代谢谱研究

Schneider K, Krömer JO, Wittmann C, Alves-Rodrigues I,Meyerhans A, Diez J,Heinzle E.Microb Cell Fact. 2009 Jan 30;8:12.

某些正链病毒的复制需要细胞蛋白Pat1p、Lsm1p 和Dhh1p，因此这些蛋白可以作为新型抗病毒药物的潜在靶标。为了优选宿主靶标进行抗病毒药物筛选， 我们对酿酒酵母标准株BY4742、Matalpha、his3Delta1、leu2Delta0、lys2Delta0、ura3Delta0 和缺失突变株pat1Delta、lsm1Delta 和dhh1Delta进行了比较代谢组学分析。结果：GC/MS 分析能够对47 种极性代谢物进行定量，并鉴定出其中的41 种。通过对特征结构进行了偏最小二乘分析(PLS-DA)，鉴定了两种病毒株之间存在明显差异的代谢物。分析表明，pat1Delta 与标准株之间的最小差异可以用标准化峰面积的欧几里得距离表征。该株的生长速度和乙醇与甘油的产生速度也最为相似。结论：根据这些结果，我们推断人酵母类似物Pat1p 最有可能成为良好的药物靶标。