Life Tech Ion Proton和PGM被用于提供癌症检测

作者：Monica Heger

OncoDNA是比利时病理学和遗传学研究所（IPG）的一家附属公司，它将在Life Technologies的Ion Torrent测序平台上提供基于定向测序的癌症检测，以协助指导患者的治疗。

测序将由IPG来完成，它也是这家私有公司的主要股东，而OncoDNA将负责相关的分析和IT工作，以及市场推广。

该公司由CEO及创始人Jean-Pol Detiffe领导，他曾是DNAVision的CEO及创始人。IPG的医学病理学家Pierre Lefesvre将担任公司的医学总监。

Detiffe还表示，公司还打算聘请数据库管理员、IT部门经理、网站管理员、生物信息学家以及分子生物学家。

Detiffe向《临床测序新闻》透露，公司目前提供PGM上的48个基因的Ion AmpliSeq癌症分析，计划明年初在Proton上运行Ion 400个基因的全面癌症分析以及外显子组测序。

Detiffe说，IPG最近才收到Proton，但预计年底会在Proton上验证更大规模的分析，计划明年开始在Proton上测序外显子组。目前，外显子组测序是外包给服务供应商。

该公司正在寻求比利时当局的ISO 15189认证，认证于上个月刚审核过。

IPG目前有Proton和PGM各一台，此外它还拥有罗氏454的GS FLX以及Sanger测序仪，这些主要是用于体质性分析，如BRCA检测。

该公司最近从公共和私人投资者处募集了200万欧元（261万美元）。这些投资者包括Sambrinvest风险投资公司、葛兰素史克疫苗的前总裁Jean Stephenne，以及医疗器械公司IBt的前CEO François Blondel。

小规模的癌症分析将花费700欧元（914美元），周转时间约为10天。较大规模的分析和外显子组测序的价格和周转时间尚未确定。

OncoDNA已开始接收患者样本，样本主要是来自IPG的合作医院和制药公司的临床试验。Detiffe表示，公司也准备将分析推广到整个欧洲地区的医院、其他开展临床试验的制药公司、癌症研究中心以及肿瘤科医生。

该公司正在建立它自己内部的突变数据库，并链接到现有药物和临床试验。

Detiffe表示，他的想法是通过“三层法”来分析患者的肿瘤，首先是从小规模分析开始，主要筛选与现有药物或临床试验相关的可行动突变。如果第一轮未找到突变，则为患者提供更大规模的分析，目标经过扩展，包含与仍在开发的药物相关的突变，如果前两轮分析都失败，则开展外显子组测序。

该公司还致力于创建完整的网页形式报告，这将包括来自组织病理报告的数据、测序数据、患者有资格参与的临床试验的信息，序列数据表明可能有效的现有药物列表以及序列数据表明可能无效的药物列表。