氨基酸代谢组学案例分析

简介：

在自然界中共有300多种氨基酸，其中构成天然蛋白质的α-氨基酸有20多种，如甘氨酸（Glycine）、丙氨酸（Alanine）、缬氨酸（Valine）、亮氨酸（Leucine）、异亮氨酸（Isoleucine）、苯丙氨酸（Phenylalanine）、色氨酸（Tryptophan）、酪氨酸（Tyrosine）、天冬氨酸（Aspartic acid）、组氨酸（Histidine）、天冬酰胺（Asparagine）、谷氨酸（Glutamic acid）、赖氨酸（Lysine）、谷氨酰胺（Glutamine）、甲硫氨酸（Methionine）、精氨酸（Arginine）、丝氨酸（Serine）、苏氨酸（Threonine）、半胱氨酸（Cysteine）、脯氨酸（Proline）等。阿趣生物借助上海交通大学通过国家计量认证的具有雄厚的科研实力及丰富经验的全自动氨基酸分析平台，对外提供公正权威的检测分析服务，可以对生物样本中40多种游离氨基酸进行定性定量分析。

检测分析：

相关案例：

疾病研究：主动脉夹层分离病人血浆的氨基酸轮廓谱研究

研究对象：人

分析检测平台：LC-MS/MS

期刊：Scientific Reports

影响因子：5.228

发表时间：2017

摘要：

Aortic dissection (AD), a severe cardiovascular disease with the characteristics of high mortality, is lack of specific clinical biomarkers. In order to facilitate the diagnosis of AD, we investigated plasma amino acid profile through metabolomics approach. Total 33 human subjects were enrolled in the study: 11 coronary heart disease (CHD) patients without aortic lesion and 11 acute AD and 11 chronic AD. Amino acids were identified in plasma using liquid chromatography and mass spectrometry (LC-MS/MS), and were further subjected to multiple logistic regression analysis. The score plots of principal component analysis (PCA) and partial least squares-discriminate analysis (PLS-DA) showed clear discrimination of CHD patients with AD, acute AD or chronic AD patients, respectively. The contents of histidine, glycine, serine, citrate, ornithine, hydroxyproline, proline and sarcosine were significant different in acute AD patients comparing with CHD patients. The levels of citrate, GABA, glutamate and cysteine were significant different in chronic AD patients comparing with CHD patients. The contents of glutamate and phenylalanine were significant changed in acute AD patients comparing with chronic AD patients. Plasma aminograms were significantly altered in patients with AD comparing with CHD, especially in acute AD, suggesting amino acid profile is expected to exploit a novel, non-invasive, objective diagnosis for AD.

Keywords: Aortic dissection (AD) ，liquid chromatography and mass spectrometry (LC-MS/MS) , plasma amino acids profile

研究背景：

主动脉夹层分离是一种潜在的高死亡率的血管疾病，其中主动脉腔内血液从主动脉内膜撕裂处进入主动脉中膜分离，沿主动脉长轴方向扩展形成主动脉壁的二层分离状态，该状态的主动脉容易扩大出现致死性大动脉破裂。如果没有及时治疗，48小时内的死亡率达到50%-60%而两个星期内的死亡率高达80%，因此及时性的诊断治疗就是拯救生命。

目前为止，主动脉夹层分离主要的诊断方法有螺旋计算机断层扫描血管造影、磁共振成像或术中可视化技术如经胸廓或食道的超声心动图。这些技术不仅价格昂贵，而且患者需要转移到特殊的诊断中心。此外，广泛使用的螺旋计算机断层扫描血管造影技术让患者暴露在海量的辐射下，可能会诱发速发型过敏反应和介质对比肾病。因此，发现能够预警主动脉夹层分离疾病的生物标记物，不但对帮助医生进行及时的诊断和治疗具有重大意义，而且能够拯救主动脉夹层分离患者宝贵的生命。

人体的20%是由氨基酸及其代谢物组成，在人体中各项代谢中具有重要的作用。已有报道表明肝硬化和非小肺细胞癌患者的血浆中氨基酸浓度具有显著性差异。此外，血浆的氨基酸轮廓谱能够被用于区分乳腺癌患者、食管癌患者、头颈癌患者与健康人群。因此，本文拟采用血浆的氨基酸轮廓谱技术研究主动脉夹层分离患者和冠心病患者的氨基酸表达差异，从而为主动脉夹层分离疾病的诊断和治疗提供新的方法和技术。

二、方法流程：

三、研究结果与讨论：
1 病人的基本临床信息：
1）与心脏病患者相对比，急性主动脉夹层分离和慢性主动脉夹层分离患者的BMI值显著较高；
2）与心脏病患者相对比，急性主动脉夹层分离和慢性主动脉夹层分离患者血浆中的K含量显著性降低；
3）与急性主动脉夹层分离患者相对比，慢性主动脉夹层分离患者血浆中的K含量显著性降低；
4）性别、年龄、收缩压、尿素、肌酐以及Na含量临床指标在3组对比中无显著性差异。

表1人血浆的临床数据信息

2 血浆LC-MS/MS氨基酸代谢组学检测
1）通过多重反应监测（MRM）检测出40多个氨基酸，并使用氨基酸标准品进行碎片和保留时间信息的匹配验证；
2）质控QC样本中氨基酸的RSD值0.00-14.61%。

图2 MRM方式获得的氨基酸色谱图

3 主成分分析（PCA）判别主动脉夹层分离和冠心病患者：
1）3D-PCA分析表明主动脉夹层分离患者显著性区别于冠心病患者；
2）3D-PCA分析表明主动脉夹层分离分型患者（急性和慢性）显著性区别于冠心病患者。

图3 冠心病和主动脉夹层分离患者的PCA模型得分图

图4 冠心病和主动脉夹层分离患者分型（急性和慢性）的PCA模型得分图

4 偏最小二乘判别分析（PLS-DA）判别主动脉夹层分离和冠心病患者：
1）PLS-DA分析表明主动脉夹层分离分型患者（急性和慢性）、冠心病患者三组间都显著性区别于各组；
2）与冠心病患者相对比，急性主动脉夹层分离患者血浆中alanine, phenylalanine, leucine, α-amino-n-butyrate, methionine和asparate含量增高, 而 hydroxyproline, glutamine, glycine, proline, ornithine, citrate, glutamate, sarcosine, histidine和serine含量降低；
3）与冠心病患者相对比，慢性主动脉夹层分离患者血浆中glutamate, leucine, lysine 和 cystine 含量增高，而hydroxyproline, serine, citrate, glycine, GABA, ornithine, proline, histidine, alanine和glutamine含量降低；
4）与急性主动脉夹层分离患者相对比，慢性主动脉夹层分离患者血浆中phenylalanine含量增高，glutamate含量降低。

图4 冠心病和主动脉夹层分离患者分型（急性和慢性）的PLS-DA模型得分图

5 主动脉夹层分离患者差异显著的氨基酸代谢物分析：
1）基于VIP＞1、P-value＜0.05，发现8个显著性差异氨基酸区别于急性主动脉夹层分离患者和冠心病患者，4个显著性差异氨基酸区别于慢性主动脉夹层分离患者和冠心病患者，2个显著性差异氨基酸区别于急性主动脉夹层分离患者和慢性主动脉夹层分离患者；
2）与冠心病患者相对比，急性主动脉夹层分离患者和慢性主动脉夹层分离患者血浆中柠檬酸是共同差异显著性代谢物。

表2人血浆中差异显著的氨基酸

四、亮点和展望：
1 LC-MS/MS氨基酸轮廓谱分析表明冠心病患者与主动脉夹层分离患者、急性主动脉夹层分离患者、慢性主动脉夹层分离患者表型具有显著性差异；
2 通过将急性主动脉夹层分离患者与冠心病患者相对比，发现histidine、glycine、serine、citrate、ornithine、hydroxyproline、proline和sarcosine具有显著性差异；
3 与冠心病患者相对比，慢性主动脉夹层分离患者血浆中的citrate、GABA、glutamate和cysteine含量具有显著性差异；
4 与慢性主动脉夹层分离患者相对比，急性主动脉夹层分离患者血浆中glutamate和phenylalanine含量具有显著性差异。
A 组氨酸-组胺代谢通路在主动脉夹层分离患者机体作用的详细机制还需进一步研究；
B 甘氨酸在急性主动脉夹层分离患者中心血管内皮细胞中发挥的功能以及在甘氨酸代谢综合征中的详细作用机制需要深入研究；
C 在未来将不断优化实验条件提高捕获更多氨基酸的能力。

阅读文献：
L Wang, S Liu, W Yang, et al. Plasma Amino Acid Profile in Patients with Aortic Dissection. Sci. Rep. 7, 40146; doi: 10.1038/srep40146 (2017).
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