长链非编码RNAs（long non-coding RNAs，lncRNAs）是一类长度大于200 nt且不编码蛋白质的RNAs（不含rRNA），广泛存在于各种生物体内。lncRNAs参与表观遗传、转录以及转录后等多水平的调控过程，在生命活动中具有重要作用。华大科技推出的lncRNA测序服务，使用高通量测序技术结合先进的生物信息学分析，一次性获得样本中几乎全部的lncRNAs信息，为您全面、深入地研究lncRNAs的功能提供了全新的工具。

技术优势

1. 技术稳定，建库重复性好：同一样本重复建库相关性Pearson值大于0.993；
2. 基于高通量测序技术，可一次性获得样本中几乎全部的lncRNA信息；
3. 不局限于对已知lncRNA的研究，还可进行novel lncRNA的预测；
4. 除人和鼠外，还可应用于其他真核物种，可共同制定定制化研究方案。

研究内容

一、标准信息分析

　　1. 基本数据统计

　　　1.1 去除接头序列、低质量序列得到clean data

　　　1.2 与核糖体数据库比对，去除核糖体RNA数据

　　2. lncRNA鉴定

　　　 2.1 转录本组装

　　　 2.2 鉴定已知转录本（包括已知lncRNA）和新转录本

　　　 2.3 预测新的lncRNA

　　3.  lncRNA定量及差异表达分析

　　　 3.1 lncRNA定量及差异分析（需至少2个样品）

　　　 3.2 组间差异分析（需至少2组，每组至少3个样品）

　　　 3.3 lncRNA差异表达模式聚类

　　4.  lncRNA功能预测

　　　 4.1 基于互补序列的lncRNA-mRNA互作分析

　　　 4.2 基因上下游的lncRNA分析

　　　 4.3 miRNA前体预测

　　 5.  lncRNA家族预测分类

二、高级信息分析

　　1. CNC（coding-non-coding）共表达注释（需5对以上case+control）

　　2. Pathway富集分析

更多详细信息请访问

http://www.bgitechsolutions.cn/service-solutions/ngs/transcriptomics/lncrna-seq/

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