Ion Torrent PGM测序仪

nt PGM测序仪,是市场上相较其他测序技术,更简单,更经济和具有强大的可扩展性的测序

台。 lon Torrent台式系统的设计配合革新性的半导体芯片技术,是整个平台具有极高的扩展性和快速完成

测序的性能

lon torrent技术通过专有的大规模并行半导体感应器,对于DNA复制时产生的离子流,实现直接和实时的检

测。当试剂通过集成的流体通路进入 on Torrent半导体芯片中,密布于芯片上的反应孔立即成为上百个微

反应体系。这种独特的流体体系、微体系机械设计和半导体的技术组合,使我们得以快谏直接的将遗传信

息翻译成数码的DNA测序结果,得到大量高质量的测序数据

产品特点

1、通量高:318芯片一次测序能出5M的有效 Treads

通量灵活:有3种不同通量的芯片可供选择,可根据所要研究的微生物数据垦和样本量,灵活安排测序

试验,成本和时间上双重平衡研究进度

3、单端读长长:单端读长可达500bp,满足宏基因组菌群分析和徹生物Denoτ测序的需求

4、快速:1天就可拿到测序结果,是最快的二代测序平台

操作简捷:自动化程度高,手工操作时间非常少

6、淮确性高:500bp测序质量均一、稳定,H-Q酶进一步提升测序质量

7、成套方案:针对石油微生物硏究中主要用到的应用——宏基因組菌群分析和微生物的Deηoτo测序,有

善的解决方案

8、售后支持:大于20人的售后实验和数据分析支持团队,具备强大的开发能力

工作流程:

☆收藏

构建文库

制备模板

分析数据

本 clon plus片段文 on chef系统在 on Pgm测序仪采用 Torren套装

库试剂盒或lon短短几分钟内就可能够采用400或软件完成主要的数

PLus片段提供简单、高通量200b测序进行快据分析

文库试剂盒在短短的模板制备

速的 de novo测序。

DNAStar SeqMan

2小时内便能提供

仅需37小时即

NGen"软件包

低成本的样本制备

完成运行

on pgm系统的性能规格

Ion314M芯片v2Ion316M芯片v2Ion318M芯片v2

00个碱

产量基

30-50Mb

300-600Mb

600 M6-1 Gb

400个碱

60-100Mb

600 Mb-1 Gb

2-2Gb

40-55万个

200-300万个

400-550万个

运行时200个碱

3小时

3.0小时

44小时

研究领域

癌症研究

干细胞研究

宏基因组学

遗传病硏究

衣业

微生物学

表观基因组学

古老DNA基因组学

关键应

de novo微生物测

ChP测序

拷贝数分析

细菌分型

甲基化分析

定向RNA测序

病毒分型

小RNA测

宏基因组学

测序法基因分型

目标选择

方案

Ion AmpliSegTM技术 Ion TargetSeq M技术

立10 n Ampliseq a Ion Total RNA-Seq Kit384个条形码, Torrent

Library Kit

Ion XpressTM Plus Ion Library Equalizer M

软件所支扫

Library Kit

数据分析

rrent suite软件处理信号,检岀碱基,比对序列,并开展基本变

异检出,作为 on PgmrM测序仪的初步

分析软件。

其他应用的优化数据分析流程已开发

利用第三方软件方案和免费下载的插件

Ion Reporter软件开展可控的变异分析、注释和报告,而应用特异

的流程支持单个、家系以及配对的肿瘤

正常分析。 Ion Reporter oncomine流程再加上 Ion Amplis

DNA panel,让癌症研究人员能够解决区

分癌症司机突变和乘客突变的关键挑战。

PGMM Torrent服务器的规格

产品配置单个独立的塔式计算机设备,包含在 Ion Pgmm系统

包括 Torrent Suite软件及所有必要的软件组件,带来信号处理、碱基检

出、读取比对和变异检出

处理器两个6核2.66 GHZ CPU

48 GB RAM

GPU处理器1 K NVIDIAB Tesla GPUs

存储(约)16TB

屎作系统 Ubuntu10.04

尺寸宽度:85im21.6cm深度:223m566cm高度:23i566cm

1001b45kg

电源

电压:100V(min)-240

频率:5060Hz

V(max)

电流:6.7A(max)功率:1,100W

数据格式行业标准的 FASTQ、SFF、BAM和CF格式辅出

应用方向

发现与鉴走

全基因组鸟枪法测序为微生物的发现与鉴定提供了重要的新机会。 Ion Torrent半导体测序提供了一个简

单、低成本的系统,能在一天内带来准确的结果

2宏基因组学

Ion半导体测序通过全基因组测序或对细菌16SRNA基因的走向测序(16S测序来加速和简化宏基因组研

究。无需在测序之前克隆样品,避免了抽样时的一个主要偏向。样品在 FIon pgmim系统上可直接测序,有

更多扩塇子,可更好地区分不同生物体。

Ion半导体测序匹配 Ridom M SeqSphere+M自动化软件能够提供快速、低成本的完整基因组序列信息,通过

采用成百上千个分型基因,可对个别菌株实现更高分辨率和更为准确的分型。在一个工作日內,即可对特

定分离株进行测序和銮定,从而有望为疾病爆发的监测提供实时结果

4病毒分型

Ion pgm系统匹 PathAmp fluA试剂以及 Torrent suiters软件的病原体分析仪插件为甲型流感病毒完整

基因组测序提供了最新型的工作流程。利用高度准确的序列数据,研究人员能够在一天之內实现甲型流感

病毒的分型,从而启动更为有效的流感监测。这使研究人员得以精心优选疫苗菌株,并改进未来抗原特性

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注：该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案，不可用于临床诊断或治疗等相关用途