illumina MiSeq台式DNA测序仪

MiSeq性能参数

MiSeq的规格

簇生成和测序

* 总时间包括MiSeq系统上双表面扫描所实现的簇生成、测序和碱基检出。

通过过滤的read^**

** 安装参数是基于在所支持的簇密度下运行Illumina PhiX对照文库 (对于V2版本，通过过滤的簇密度是865-965 k/mm² ；对于V3版本，通过的簇密度是 1200-1400 k/mm² )。根据样本类型、样本质量、通过过滤的簇的不同，真实的性能参数可能有所差异。

质量值^†

† 总时间包括NextSeq 500系统上双表面扫描所实现的簇生成、测序和碱基检出。

参考性能参数：

说明：

1、以上性能需要Miseq V2试剂进行测序。V1试剂仅支持2×150bp，上机时间27小时左右，产量1.5-2Gb，Q30>80%，目前已不再订购V1试剂。

2、该数据基于Illumina标准品PhiX（碱基分布均匀的DNA样品），推荐上机密度为950-1200K/mm2，PF后约880-965K/mm2。而不同的样品的测序结果会受到自身性质的影响。

参考招标参数：广州医科大学采购广医三院高水平大学建设项目(三)（0809-1741GZG12314）

分包4：高通量二代测序仪1台

1.一轮测序反应生成的有效数据量zei高可达15Gb（即150亿个碱基）；

2.一轮测序反应生成的可读测序片段序列zei高可达2500万条；

3.支持读长高达 2×300 bp 的运行；

4.测序质量标准为Q30（即每个碱基的准确度为99.9%），并且75%以上的碱基比例达到Q30；

5.样本文库克隆扩增原理为桥式PCR法；

6.具备多重SNP分析功能，可在一轮实验中同时检测超过589,000个扩增子，（即384样品x1536扩增子/样本=589,824扩增子）；

7.测序系统主机内置服务器，主机同时具备样本文库克隆扩增、测序和数据分析功能；无需油包水PCR；

8.可精确读取≥12个的连续重复碱基（如AAAAAAAAAAAAAAAA）；

9.能符合上述指标的测序系统主机1套,包括了样本文库自动扩增和数据分析功能；仪器控制服务器配置：Intel Core i7-2710GE 2.10GHz CPU，16GB RAM，750G硬盘，采用Win7 Embedded Standard操作系统；无需再配置额外的分析服务器；

10.仪器同时具备并免费提供以下软件分析功能：全基因组重测序、定向重测序、癌症定向测序、定向富集测序、目标RNA表达测序、小基因组de novo测序、小RNA测序、16s宏基因组学研究、建库质量控制(QC)、小基因组转录组测序；支持云端分析；

11.开展完整的数据分析无需用户干预，从质量打分的碱基检出到变异体检出和比对所需时间小于3小时。

参考招标参数：北京市儿科研究所肿瘤分子研究平台建设项目 0733-166220900101

第 2 包：

新一代个人化测序仪

1.主要用途：未知物种全基因组测序，已知物种再测序，全基因表达组定量分析，全基因组小

RNA 分析，染色质免疫互沉淀（ChIP）研究,转录组分析，扩增子测序，定向重测序；

2.工作条件 ：

2.1 温度：22℃±3℃；

2.2 湿度：20%-80%，非冷凝；

2.3 通风：zei大 1,364BTU/h；

3 技术指标 ：

3.1 测序数据通量：每次运行可生成>70 亿(7G)以上碱基数据；

3.2 测序检测片段数量：每次运行可生成可读 2,000 万个以上片段序列；

3.3 测序实验时间：可以在 8 小时内完成样品制备、测序和数据分析，用于快速鉴定；

3.4 单端读取序列数据读长：不低于 200 碱基；

3.5 双端读取序列数据读长：不低于 2x200 碱基；

3.6 测序样品用量：DNA 样本需 1ug 或更低；

3.7 读取精度：原始数据准确性≥98％, 3 倍覆盖拼接序列准确性≥99.99%；

3.8 读取精度：可精确读取≥12 个连续单个重复碱基；

3.9 读取精度：测序结果 ≥Q30 的数据超过 80％；

3.10．扩增子测序：可同时进行 96 个样品的 1536 重位点的测序；

3.11．不同样品并行性：提供稳定成熟的 96 个样品的 index 混合接头；

3.12．样品制备：可在 2 小时内自动完成；

3.13．测序实验：扩增、测序和数据分析服务器在同一台仪器上完成；

3.14．提供生物信息学支持软件：如新物种拼接，小 RNA 分析，扩增子分析，转录组分析，

表达谱分析，自动去除 index 序列并分拆混合样品的数据等。