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中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所

中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所

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  高性能计算集群

  研究所建立的高性能计算机集群系统, 拥有高性能运算服务节点共250余台, 高性能 cpu 核 1200个。其中, 最早安装的10台Macintosh运算服务器, 拥有20颗基与PowerPC G5,支持加速向量引擎,主频为2.33GHz 的CPU, 此后安装了109台 IBM, HP 高性能运算运算服务器,拥有双路,双核,主频为2.2GHz 的AMD Opteron CPU, 从去年年底到目前为止, 我们一共安装了基与Intel XEON 双路四核处理器,主频为2.6GHz的高性能运算服务节点110 余台.每台服务器均配置了总量超过4GB的DDR2 内存, 部分高配节点更是达到了32G 内存. 这保证了用户对大内存的计算需求。

  在我们的集群系统中,安装有基与64位新一代Mac OS X Leopard 的操作系统,和支持更为开放 x86指令集和AMD64架构的红帽Linux 操作系统。

  此外我们在扩展运算能力的同时,我们提供了近40T基与光纤连接的高可靠性能中央存储, 并配置了具有80个槽位的LTO4(单盘容量可高达160G ) 海量磁带库备份系统。

  Uli Schwarz实验室介绍

  Uli Schwarz实验室 筹建于2008年春,10月16日举行揭牌仪式,正式投入运行。实验室整合了全所6个课题组实验室及马普客座实验室,作为一个实验技术公共平台服务于全所各个课题组,满足研究所内对各类生物实验的需求及举办实验技能培训班等,更好地开展科研工作以获得更多的研究成果。

  目前Uli Schwarz实验室 总占地面积为102m2,购置了各类分子生物学、生物化学及细胞生物学等实验仪器设备,包括高通量芯片毛细管电泳进行DNA和RNA分析的Agilent 2100 Bioanalyzer、实时定量PCR操作的Light Cycler 480、极微量样本检测的NanoDrop ND-1000、细胞培养专用的倒置显微镜系统和荧光显微镜系统等。

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