蛋白质“社交平台”建成上线

2016-11-30 16:34 来源: 科技日报
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  美国科学促进会(AAAS)科技新闻共享平台EurekAlert! 29日报道称,目前最大的蛋白质—蛋白质相互作用网络数据库建成上线,该数据库集合了超过62.55万组蛋白质间相互作用,这种规模的数据资源可以阐明多种基因对疾病发展的影响。

  映射大规模蛋白质—蛋白质相互作用网络的重要性被广泛认可,但相关数据分散在各种学术文章中。美国、丹麦和英国研究人员合作,整合了来自43000余篇发表文章的数据,创建了这一名为“InWeb_InBioMap”的数据库。

  团队负责人卡斯培·拉吉博士说,现代遗传技术让定期对癌症或精神疾病患者基因组进行测序成为可能,但是,了解受致病遗传变异影响的细胞系统仍然是一个重大挑战,而“拥有人类蛋白质物理相互作用的更完整地图,将使我们比以往更精准地探索受疾病影响的细胞过程”。

  团队联合主编李泰博(音)解释说,就像人类社会一样,蛋白质喜欢在小组中开展工作。“脸谱社交平台可以基于网络间交互模式和兴趣共享来推断彼此可能认识的人,蛋白质间相互作用网络也是如此”,通过探索可能致病的蛋白质间相互作用网络,可以推断基因组和分子的路径,进而加深对发生在人类细胞中生命过程的理解。临床医生可以借此观察遗传数据模式,为寻找新的致病基因提供新的分子学视角。

  据介绍,该小组还在继续开发该资源数据库的其他使用方法,比如通过整合蛋白质组、转录组和基因组数据,以改进对复杂生物系统的理解,对这些信息的应用有助于了解心血管疾病、出生缺陷、癌症、生殖障碍和精神疾病等致病机制。