业界对DNA测序公司新技术褒贬不一

2014-2-18 15:24 来源: 中国科学报
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  美国佛罗里达州马可岛被奉为基因测序领域的圣地,每年都有大批研究基因测序的公司及科研人员会聚于此,分享最新科技成果。两年前,英国牛津纳米孔技术公司曾宣布,该公司已成功研发出对特定DNA片段进行测序的新技术,但很多人认为该方法并不现实。与其他技术相比,这一技术可以阅读更长的DNA片段(因此有望用于对细菌DNA的混合样本进行测序),并能实时显示结果。这种测序采用电泳技术,借助电池驱动单个分子逐一通过纳米孔实现测序。由于纳米孔的直径非常小,仅仅允许单个核酸聚合物通过,因此,可以在此基础上使用多种方法进行高通量测序。而且,纳米级别的孔径保证了检测具有良好的持续性,因此测序的准确度非常高。

  经过两年的沉寂,日前该公司又投下了一颗“重磅炸弹”。尽管该公司并未派人到佛罗里达参会,但和该公司合作的一名研究人员在会上报告,他已经利用新技术成功对病毒进行测序,并利用收集到的数据将微生物基因组信息拼凑在一起。现在,该公司已经在兑现先前的承诺,并呼吁科学家加入到检验新技术的项目中。然而,并不是每个人都看好该公司的这一“壮举”,很多人认为在没有外界帮助的情况下,其获得的 DNA测序数据很难分析出完整的基因组信息。

  与此同时,很多传统基因测序公司也在你追我赶,致力于降低测序成本。Illumina公司是目前最大的测序仪器制造商,1月,该公司承诺让“1000美元基因组”成为现实,让基因测序成为医疗服务的常规项目。

  Illumina公司宣布的新一代测序仪能准确测出全基因组序列,其成本不到1000美元。新测序仪拥有很快的全基因组测序速度,旨在理解人类疾病和自然的遗传突变。尽管这一设想在20年前就已提出,但在2012年才成为现实——当时英国牛津纳米孔技术公司推出了第一款商用纳米孔测序仪。

  加州大学圣克鲁兹分校纳米孔测序技术专家David Deamer说:“我已经等不及了。人们希望赶紧尝试这种新技术。有些人希望对食物中的微生物进行实时分析以测试食品安全,梦想家希望看看该技术能否处理有16000个碱基对的DNA片段。我们已准备好向该技术发起挑战。”