中国科学家Nature Genetics发表GWAS研究新成果
来自复旦大学、电子科技大学、新加坡国家眼科中心等机构的研究人员，采用全基因组关联研究（GWAS）鉴别出了与原发性开角型青光眼相关的新易感基因。研究结果发表在8月31日的《自然遗传学》（Nature Genetics）杂志上。
复旦大学的孙兴怀（Xinghuai Sun）教授以及任职于电子科技大学医学院和四川省人民医院的杨正林（Zhenglin Yang）教授是这篇论文的共同通讯作者。孙兴怀教授的研究方向是青光眼和视神经疾病的诊治、研究。杨正林教授是我国眼睛疾病基因研究领域的知名专家。
青光眼是一种眼内压间断或持续升高的眼病，持续的高眼压可以给眼球各部分组织和视功能带来损害，如不及时治疗，视野可以全部丧失而至失明。青光眼是导致全球人类不可逆性失明的第二大原因，其被广泛分为开角型青光眼和闭角型青光眼两类。急性闭角型青光眼则往往眼压突然升高，对视力造成直接损伤，是一种疼痛性的眼科急症。相比之下，由于其病程发展缓慢往往遭到忽视，开角型青光眼有时被称作是沉默的视觉偷盗者。
全基因组关联研究（Genome-Wide Association Studies，GWAS）是指在全基因组层面上，开展多中心、大样本、反复验证的基因与疾病的关联研究，是通过对大规模的群体DNA样本进行全基因组高密度遗传标记（如SNP或CNV等）分型，从而寻找与复杂疾病相关的遗传因素的研究方法，全面揭示疾病发生、发展与治疗相关的遗传基因。
这一研究方法的引入，使对遗传流行病的发病预测不再停留在传统的年龄、家族史等“环境性”因素分析，而是通过对人体的全基因组的分析，找出可能导致今后发病的基因，并结合“环境性”因素，得出包括癌症在内的多种流行病的发病率。
在这篇新文章中，研究人员针对来自中国南方的1,007名罹患高压青光眼（HPG）的患者以及1,009名对照人群展开了原发性开角型青光眼GWAS研究。他们观察到在9q31.1上ABCA1基因附近的多个SNPs的关联性达到了全基因组的显著水平，并获得了一些证据表明还与16p13.2上的PMM2基因有关联。
随后，他们在分别来自新加坡的525个HPG病例和912个对照，以及来自中国的1,374个原发性开角型青光眼病例及4,053名对照人群中验证了研究发现。研究人员观察到两个位点上多个SNPs的关联性达到了全基因组的显著水平。ABCA1和PMM2都表达于小梁网、视神经和其他眼睛组织中。此外，ABCA1还高水平表达于视网膜节细胞层，这与它在青光眼形成中所起的作用相一致。
这些研究结果为我们更深入地了解青光眼的发病机制，为青光眼高危人群预警、早期诊断、个体化预防和治疗以及新型高效药物的筛选提供了理论依据和分子靶标。
不久前，杨正林教授课题组还与重庆医科大学附属第一医院的杨培增教授团队合作，通过GWAS鉴别出了伏格特小柳原田综合征(Vogt -Koyanagi-Harada syndrome ，VKH)新风险位点。研究结果提供了关于VKH综合征遗传学和生物学的一些重要新见解。
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