新测序技术将彻底改变白血病治疗

2016-10-18 14:13 来源: 生物通
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  在白血病这种疾病中,每个细胞都可能表现出不同的遗传性状,现在,来自瑞典的研究人员已经找到了一种廉价的方法来检测单个细胞。这一研究突破发表在10月14日的《Nature Communications》,可能彻底改变白血病的治疗。延伸阅读:单细胞研究在治疗儿童急性淋巴细胞白血病中的重要作用。

  细胞内挤满了基因信息,它们可以用来改善疾病治疗,如癌症,但今天通常使用的RNA测序方法存在一个限制:它们不能确定哪个细胞中正在发生基因活动。

  最近在《Nature Communications》发表的研究中,瑞典的研究人员提出了一种新方法,他们用该方法来检测慢性淋巴细胞白血病(CLL)患者的单个肿瘤细胞,考虑到该团队发现白血病肿瘤是由具有完全不同的基因表达的细胞组成,这项研究结果可以说是一个重要突破。

  瑞典皇家理工学院基因技术教授和生命科学实验室基因组学平台主任Joakim Lundeberg说:“我们发现,CLL细胞并不只包含一种单一的细胞类型,而是多个亚克隆,它们表现出完全不同的基因表达。”

  通常情况下,RNA测序能够提供有关“生物样品中存在什么RNA分子”的信息,而不是“它们在哪里或哪个细胞内是活跃的”这样的信息。

  他说:“有了这种新的、非常符合成本效益的技术,我们现在可以对血液肿瘤样本内的这种复杂性获得一个全新的看法。单细胞的分子分辨率,有可能成为一种更广泛使用的治疗选择。”

  Lundeberg说,这种方法可将一个位置标签附加到分子上,对单个细胞中所有的mRNA分子进行分析。

  研究人员在一个特制的玻璃表面上对单个细胞进行分类,并用新一代测序对RNA分子进行分析,就可以确定哪些基因是活跃的。玻璃表面上的空间信息,可以告诉我们一个特定的RNA分子是在哪一个细胞内被发现的。

  Lundeberg表示:“我们还开发了一个开放的、可用的软件(www.spatialtranscriptomicsresearch.org),可将单个细胞的图像与来自测序的信息结合起来,即,哪些基因被表达,以及在什么水平上表达。”他说:“用新的方法和软件,我们可以在一天的时间内研究成千上万个细胞。”