黄海所：发现刺参免疫通路基因
灿烂弧菌（Vibrio splendidus）是刺参（Apostichopus japonicus）腐皮综合症的主要致病因素之一，严重危害刺参养殖产业的发展。
为筛选涉及灿烂弧菌侵染的刺参免疫基因，并探索这一过程的分子机制，中国水科院黄海水产研究所王印庚研究员领衔的课题组对灿烂弧菌侵染的抗性型和敏感型刺参的相关转录组和基因表达谱进行了系统分析。
研究人员使用转录组测序共获取319,455,942个Reads，组装成186,658个contigs。之后，对89,891个代表性的contigs（无异构体）进行聚类分析。接着采用DGE测序对基因表达谱进行分析（转录组测序和DGE测序项目均由联川生物承担完成）。相比于对照组，在细菌抗性组中鉴定出358个差异表达基因（DEGs），在细菌敏感组中鉴定出102个DGEs。参照文献报道和来自BLAST，GO和KEGG的注释信息，研究人员从DEGs中鉴定出30个假定的细菌抗性基因和19个假定的细菌敏感基因。此外，还找到了许多差异表达基因参与免疫信号相关通路，如细胞内吞作用，溶酶体，MAPK，趋化因子和ERBB信号通路。
参考文献
Gao Q, Liao MJ, Wang YG, et al. (2015) Transcriptome Analysis and Discovery of Genes Involved in Immune Pathways from Coelomocytes of Sea Cucumber (Apostichopus japonicus) after Vibrio splendidus Challenge. Int J Mol Sci 6(7), 16347-16377.
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