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深度测序揭示埃博拉病毒何以产生多样性

2014.11.10

  最近,研究人员发现,RNA编辑会导致埃博拉病毒的mRNA多样性,但是这对病毒来说意味着什么呢?了解更多……

  来自西奈山伊坎医学院、加尔维斯顿国家实验室和J. Craig Venter研究所的研究人员发现,线状病毒——包括埃博拉病毒和马尔堡病毒,在感染期间,会产生比以前预计的范围更广的基因产物。相关研究结果发表在2014年11月4日的《mBio》,在这项研究中,本文资深作者、西奈山伊坎医学院的Christopher Basler发现,在转录过程中病毒聚合酶会停滞在某些特定的基因组位置,并将额外的核苷酸添加到非经典的病毒RNA编辑过程中。

  本文第一作者、J. Craig Venter 研究所助理教授Reed Shabman在一份新闻稿中这样说道:“我们的研究表明,埃博拉病毒正在制造一些以前未描述的蛋白质形式。”

  研究人员首次在一系列深度测序实验中,发现了这些修饰的病毒RNA,这些实验重点在于理解不同线状病毒的转录、复制和病毒生命周期,包括引起当前西非疫情的埃博拉病毒,和引起2005年安哥拉疾病爆发的相关马尔堡病毒株。测序数据在这些病毒中揭示了一些以前未知的区域,这些区域的共转录(cotranscriptional)编辑可导致非模板编码的残基添加到一些病毒mRNA中,包括编码糖蛋白、核蛋白和聚合酶的mRNA。

  我们知道,其他病毒聚合酶也在某些位置停滞,从而产生类似的非模板核苷酸添加物,但是这是第一次在丝状病毒中确定这样一种机制。有趣的是,当作者研究了来自不同疫情爆发区的各种埃博拉病毒时,他们发现,非常规的编辑位点,在不同病毒株之间是高度保守的。

  虽然在感染期间病毒产生的mRNA产物具有明显扩大的多样性,但是这些修饰的RNA其所产生的影响和相关性尚不清楚。Basler说:“我们知道这些变化发生,但是我们不知道在病毒生物学中这意味着什么。”他指出,因为对于“病毒如何复制“我们还有很多不了解的方面。因此,我们需要对它们如何成长有一个完整的描述,以开发新的策略来治疗感染。

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