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测序首次鉴定鲨鱼肝脏microRNA组

2013.7.01

  条纹斑竹鲨(Chiloscyllium plagiosum),是主要栖息于沿海礁砂混合且海藻繁生的海床中的一种鱼类,卵生,对其生活习性我们还不甚了解,可能以底栖无嵴椎动物及小鱼为食。条纹斑竹鲨具有一定的经济价值,可在水族馆中展示,食用可治疗佝偻病、外痔、 水火烫伤、夜盲症等。microRNAs(miRNAs)是调控广泛的生物过程中不可或缺的成员,对条纹斑竹鲨进行miRNA研究有助于我们对这种神秘海洋物种的深入了解。近日,浙江理工大学副教授吕正兵领衔其团队,对条纹斑竹鲨肝脏中的miRNA组进行了系统研究*。

  研究人员利用测序技术首次对条纹斑竹鲨肝脏中的小RNA,特别是miRNAome进行深度挖掘(小RNA测序技术服务由联川生物提供)。测序发现,其中91个miRNAs,这些miRNA已在斑马鱼,红鳍东方鲀,青鳉,非洲爪蟾,热带爪蟾,人类,小鼠中报道,可以比对到 Callorhinchus milii基因组。此外,研究人员鉴定到156个新的候选条纹斑竹鲨miRNA。从这247个miRNAs中,研究人员一共鉴定得到39个miRNAs 簇,并且观察到这些簇的表达显著不同。研究人员进一步挑选了其中7个候选miRNAs,采用茎环RT-PCR对其表达进行验证,结果显示所有7个都在条纹斑竹鲨肝脏中有表达。

  本研究结果,为进一步研究miRNA在条纹斑竹鲨肝脏发育过程中的调控作用奠定了基础。

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