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Nature Methods:新方法测定基因组中的足印

2009.7.27

  科学家们发明一种新方法,可以在活体中测量蛋白质在整个线虫基因组中的占有量,新成果发表在日前在线出版的《自然·方法学》期刊上。新技术将提供基因被调控的新细节。

  这种方法背后的思想很简单:捆绑着蛋白质的基因组DNA被脱氧核糖核酸屏蔽,脱氧核糖核酸是一种消化DNA的酶,产生出一个完整无缺的DNA片断。在所对应的捆绑区域,这个DNA片断就是蛋白质的足印。这个足印的序列提示出蛋白质的捆绑序列,因此常用于鉴别调控蛋白质。

  应用脱氧核糖核酸酶Ⅰ大规模平行测序技术,John Stamatoyannopoulos和同事将这种方法放大,应用于基因组水平。他们系统化地绘制了线虫基因组中的所有足印,并用新的蛋白质模型对这些数据进行分析。结果,他们绘制出在整个线虫DNA中的所有调控蛋白质的复杂地图。

  新技术可应用于所有基因组已被测出的有机体,也有助于科学家们深入了解基因组调控的详细方式。

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