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国际“开放科学奖”！6队争夺最终霸主，斩获23万美元

2016.5.13

　　近日，美国国立卫生研究院（NIH）网站上公布了国际“开放科学奖”进入决赛的6个研究小组的消息，他们分别是OpenAQ、OpenTrialsFDA、Real-Time Evolutionary Tracking for Pathogen Surveillance and Epidemiological Investigation、Open Neuroimaging Laboratory、Fruit Fly Brain Observatory以及MyGene2，并且每个研究小组斩获8万美元的奖金。

　　从45个国家、450个发明家、96个国际队伍中选拔出的这6个决赛选队，他们将需要在12月1日之前提交开发和完善的项目技术原型。最终开放科学奖获得者，预计在二月下旬或2017年三月初公布，各队进入决赛必须至少由两个或两个以上的个人或单位，其中至少有一个成员是美国的，另一个是其他国家。决赛时，公众也将被邀请投票，明年初获胜者将出炉，并获得23万美元奖金。

　　“这些创新阐述了来源于现有数据的新知识如何促进临床试验、环境暴露和神经科学等领域的进步。”美国国立卫生研究院（NIH）副院长Philip Bourne说。NIH于去年秋天联合英国维康信托基金会启动了公开科学奖。

　　由生物医学研究产生大量的数字信息，通常被称为大数据，并在快速增长。而科研人员访问和使用这些数据具有局限性。“开放科学奖”的目的就是让这些支持服务、工具以及平台、原型设计开放，以确保大数据的共享和刺激创新。

　　2016年开放科学奖决赛的团队分别是：

　　MyGene2——共享孟德尔遗传病基因，造福罕见病患者。团队成员：

　　Jessica Chong, Michael Bamshad (University of Washington, Seattle)

　　Tudor Groza, Craig McNamara, Edwin Zhang (Garvan Institute of Medical Research, Darlinghurst, Australia)

　　OpenAQ：全球社区建设首开，实时空气质量数据中心的世界 -通过数据来自世界各地的合并提供了对空气质量差的实时信息。团队成员：

　　Michael Brauer (University of British Columbia, Vancouver)

　　Joseph Flasher (Development Seed, Washington, D.C.)

　　Michael Hannigan (University of Colorado, Boulder)

　　Christa Hasenkopf (OpenAQ, Washington, D.C.)

　　Asep Sofyan (Institut Teknologi, Indonesia)

　　OpenTrialsFDA：制作无偏临床试验数据的可访问网站——为FDA提供更好药物审批程序包。团队成员：

　　Emma Beer, Paul Walsh (Open Knowledge International, Cambridge, U.K.)

　　Ben Goldacre (University of Oxford, U.K.)

　　Erick Turner (Portland, Oregon)

　　实时跟踪进化病原体监测和流行病学调查——允许试试分析新型的流行病原体，如埃博拉、MERS-CoV Zika病毒。团队成员：

　　Trevor Bedford (Fred Hutchinson Cancer Research Center, Seattle)

　　Richard Neher (Max Planck Institute for Developmental Biology, Tubingen, Germany)

　　Open Neuroimaging Laboratory——通过使脑成像数据的协同注释，发现和分析推进脑科学研究。团队成员：

　　Roberto Toro (Institute Pasteur, Paris)

　　Satrajit Ghosh (Massachusetts Institute of Technology, Cambridge)

　　Katja Heuer (Max Plank Institute for Human and Brain Sciences, Tubingen, Germany)

　　Amy Robinson (Wired Differently, Inc., Boston)

　　Fruit Fly Brain Observatory——大脑动态数据建模，开展精神和精神病相关系统疾病研究。团队成员：

　　Aurel Lazar, Lev Givon, Nikul Ukani, Chung-Heng Yeh, Yiyin Zhou (Columbia University, New York City)

　　Ann-Shyn Chiang, Chung-Chuan Lo (National Tsing Hua University, Hsinchu City, Taiwan)

　　Daniel Coca, Dorian Florescu, Luna Carlos, Paul Richmond, Adam Tomkins (University of Sheffield, U.K.)

　　关于MyGene2：

　　MyGene2网站由美国国立卫生研究院/美国国家人类基因组研究所和国家心肺和血液研究所资助。使得患者及其家属参与临床医生和科学家寻找罕见疾病相关基因成为可能。健康信息共享也将提高人们对于基因变异如何影响孟德尔遗传病的症状和其他临床特征的认识。

　　该网站工具可以让病人和家属很容易提交材料给研究人员和临床医生分析。这将建立一个与基因数据相关联的医疗及身体档案的数据库，还可提供共享信息的渠道，并支持寻找具有相同候选基因的相似家庭档案的请求。

　　MyGene2使用一个称为Bio-LarK Concept Recognizer的软件包，可以自动拉出用日常用语书写的健康相关的条目。然后，它映射到人类表型本体（Human Phenotype Ontology），这是一个描述人类疾病特征的词汇，包括出生缺陷或独特外形。家庭还可以选择上传照片，病历和一些其他类型的辅助材料。

　　MyGene2是公开的，并且可以通过输入候选基因进行搜索，这将得到一个基因中发现的所有候选基因变异。提供数据的家庭、临床医生和研究人员可以看到来自家庭档案中的信息，以便确定候选基因的匹配度，并可联系其他家庭档案提交者。

　　研究人员开发MyGene2网站，希望通过把罕见病的基因发现变得民主化，使得患者和家庭能够为他们自己或他们的孩子追求精确的药物治疗。项目组还期待MyGene2为罕见病患者建立社区归属感。

开放科学奖

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