PNAS：新发现两种帕金森的miRNA生物标记物
通过四个基因芯片研究的汇总分析，Rosalind Franklin大学医学和科学中心的研究人员确定了两种miRNAs，可以作为帕金森综合症的生物标记物。
相比于对照组，HNF4A和PTBP1的mRNA在帕金森综合症患者的血液中具有不寻常的表达水平，该研究结果近日发表在了《Proceedings of the National Academy of Sciences》上。HNF4A的mRNA水平与疾病的恶化阶段相关，这表明它可以用于评估疾病的严重程度。这两个基因之前报道与糖尿病相关，而这使帕金森和糖尿病的关系变得更加紧密。
“生物标记物的发现和验证是改善PD临床管理的关键步骤，” Franklin大学的Jose Santiago和Judith Potashkin这样说，他们是该文的主要作者。“具体而言，生物标记物是跟踪PD临床进展和治疗有效性等必不可少的环节。”
为了寻找帕金森综合症的分子标记物，两人检测了转录组并做了基于网络的meta分析，才揭示了帕金森综合症重要的调节因子和生物标记物。
Santiago和Potashkin从四个不同的帕金森综合症的微阵列分析实验中得到了数据，其中包含了83名患者和46名健康对照者的数据。使用Meta分析对表达数据进行处理，两人发现了2781个差异表达基因，这些基因在四个研究中都具有一致的差异性。在这些基因中，有680个是上调，2101个下调。
基于基因途径进行分析，研究人员注意到，这些差异表达基因中的一部分，参与了包括T细胞受体信号、2型糖尿病以及其他一些疾病的蛋白质内质网加工的步骤。
此外，使用NetworkAnalyst的网络分析发现，HNF4A是一个关键基因；而在帕金森综合症患者中，PTBP1出现了显著的下调。
HNF4A是一种主代谢调节因子，其参与了肝脏中糖异生的激活，因此与糖尿病、炎症和脂质代谢有关。同时，PTBP1被认为在胰腺β细胞中促进胰岛素mRNA的稳定和翻译。
根据他们的网络分析，Santiago和Potashkin检测了101名帕金森综合症患者和91名健康对照者血液中HNF4A和PTBP1的mRNA水平。基于qPCR的实验表明，相比较于对照组，患者的HNF4A和PTBP1分别出现了显著的上调和下调。
事实上，他们发现，这两个基因的表达水平能以90%的灵敏度和80%的特异性区分患者，并且HNF4A和PTBP1的mRNA水平是不依赖于其他变量的，比如年龄和性别。
他们还发现，HNF4A的mRNA水平和PTBP的mRNA水平之间存在负相关，而HNF4A的mRNA水平与疾病阶段之间存在正相关，这表明HNF4A的mRNA水平可以成为帕金森综合症患者早期阶段的识别标志并用于检测疾病的严重程度。
两个假定的生物标记物的水平也随着时间变化。在50名帕金森综合症患者和46名健康对照组中，研究人员发现，HNF4A的mRNA水平相比较于对照组，其随着时间的推移而降低，而PTBP1的mRNA水平相比较于对照组，在三年后出现了上升。
“在本研究中确定的生物标记物纵向动态对于检测帕金森综合症患者疾病的治疗变化将是十分有用的，” Santiago和Potashkin这样说。
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项目成果
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