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纳米孔测序仪首次于失重环境下完成测序实验

2015.10.15

  科学家们在失重环境下进行实验,首次证实掌上测序仪MinION可以在太空中使用。

  Johns Hopkins大学的遗传学家Andrew Feinberg和Lindsay Rizzardi登上了NASA的低重力飞机,在模拟的失重环境下完成了遗传学实验。“我非常享受这种体验,感觉就像置身天堂,”Feinberg说。

  研究人员此次测试了两个关键性工具,长期保存遗传学物质所需的移液器和便携式纳米孔测序仪MinION。MinION是英国Oxford Nanopore公司推出的小型纳米孔测序仪,价格在一千美元作用,一天能生成约1Gb数据。该系统发布之后很快引起了轰动,被许多人视为基因组测序的未来。

  长期保存遗传学样品,需要把已离心的血液转入另一个管子。这个简单的工作在零重力环境下却是一大难题,因为液体很容易溢出。Feinberg和Rizzardi总共尝试了三种移液工具,包括连着塑料管的长针(NASA提供)、标准移液器和活塞式移液器(positive displacement pipettes)。他们发现活塞式移液器的效果最好,“我们没想到这种移液器在失重条件下这么好用,”Feinberg指出。

  研究人员还测试了只有巴掌大小的测序仪MinION。这是Weill Cornell医学院的遗传学家Christopher Mason提议的,他想看看MinION能否在太空中工作。研究显示,MinION能够在失重环境下测序预先制备好的DNA样本。Mason计划明年将MinION送到国际空间站(ISS)去进行实验。“这次测试的目的之一,就是看看宇航员能否在漫长的太空飞行中测序自己的DNA,”Feinberg介绍到。

  Feinberg和Mason都参与了NASA的双胞胎宇航员研究。该项目希望通过跟踪双胞胎宇航员Mark和Scott Kelly的生物学改变,了解人体如何应对太空中的极端环境。Scott已经登上国际空间站执行为期一年的任务,而退役了的Mark会一直呆在地球上。Scott定期将自己的生物学样本送回地面,以便研究人员进行比较分析。这项研究将为人们解答一个重要的问题,太空旅行会对人体产生怎样的影响。

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