第五届CPSA基础蛋白质分析会前研讨会在沪隆重举办

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第五届CPSA基础蛋白质分析会前研讨会在沪隆重举办

2014.4.15

　　2014年4月14日，第五届上海CPSA会前研讨会——基础蛋白质分析会议在上海复旦大学医学院隆重举办，吸引来自蛋白质组研究领域的专家学者参加。本次研讨会由New Objective公司赞助，与复旦大学生物医学研究院联合举办，诚邀来自Scripps Institute的John Yates博士、复旦大学杨芃原教授、New Objective公司总裁Gary Valaskovic博士、国家蛋白质科学中心(上海)黄超蘭博士、华东师范大学廖鲁剑教授带来关于蛋白质研究方法、定量研究等方面的精彩纷呈的报告。分析测试百科网作为此次活动的支持媒体，对2014 CPSA会议进行全程报道。

研讨会现场

New Objective公司中国区总裁王勇为博士

　　New Objective公司中国区总裁王勇为博士上台讲话，预祝2014 CPSA圆满召开

复旦大学杨芃原教授

　　接着，来自复旦大学的杨芃原教授上台致辞，对参加本次研讨会的各位嘉宾表示感谢，隆重介绍演讲嘉宾。

New Objective公司总裁Gary Valaskovic博士

　　New Objective公司总裁Gary Valaskovic博士为大家带来《什么是Spray DNA?》的演讲报告。ESI即电喷雾离子源，ESI-MS是较常用的一种离子化方式，具备高浓度灵敏探测器。

　　Gary Valaskovic博士在报告中指出，Spray DNA能控制整体ESI，Spray DNA具备稳定、低噪音、低RSD，高效收集，具重现性，流速高效快速和稳定等特点，同时纳喷雾发射器的位置非常重要，是从液体尖部发射出去，而样品制备，分离和离子化的整合也十分关键。

　　同时也指出，纳喷雾/LC-MS/MS关键技术方法开发还有部分不足有待提高，比如延迟更短、较低流速/微流控一体化等。

　　最后，Gary Valaskovic博士重点介绍了New Objective公司的PicoChip产品，PicoChip易于使用，即插即用，只需一次连接，可温控，工厂确保电压有效连接，重现性高。

Scripps Institute的John Yates博士

　　来自Scripps Institute的John Yates博士为与会者带来《大规模蛋白质组学的方法和数据分析》的精彩报告。

　　John Yates博士指出，蛋白质组学研究是质谱、序列和电离技术的融合。从1998年研究开始，蛋白质鉴定、肽修饰、蛋白质基因组学、序列变异、搜库等综合完整的基因组学新技术，形成集质谱、计算群、自动化ACQ数据传输、生化手段、大规模分离于一体的完整蛋白质组学。

　　目前还有很多蛋白质方面的问题暂无结果，但可以通过全基因组测序来解决。John Yates博士介绍了蛋白质组分析方法，包括：能对数据分析步骤的软件工具;ProLuCID——具有卓越的灵敏度和特异性;IP2——整合蛋白质组运输，能做到定量分析和多数据比较;定量分析工具;patternLab——功能分析工具等。

国家蛋白质科学中心(上海)黄超蘭博士

　　来自国家蛋白质科学中心(上海)质谱系统主任、中心主任助理、研究员黄超蘭博士带来《蛋白质翻译后修饰(PTM)分析的方法和数据处理》的精彩报告。

　　黄超蘭博士指出，PTM 是蛋白质生物合成中的其中一个步骤，在蛋白质翻译过程后发生的，是决定蛋白质功能的关键过程，是导致蛋白质复杂性的主要因素。现在，已经有超过300中不同类型的蛋白质翻译后修饰，其中不少是已知在细胞生理和疾病的关键角色。PTM包含四种方式，添加——糖类、酯类、磷酸基团等;酶切;AAS化学性质改变;结构改变。

　　报告指出，由于PTMs的不稳定性PTM紧密集中、通过得到特征离子等，可以通过对PTM MS数据的质量控制进行精确注释，就能够通过质谱辨别PTMs。

　　最后，黄超蘭博士指出，未来PTM还有很多挑战，比如实现PTM更高的灵敏度、更宽的蛋白丰度动态范围等;研发更稳健的定量方法来研究PTM动态，组织和开发更多的蛋白质PTM类型分析等。

复旦大学杨芃原教授

　　来自复旦大学的杨芃原教授带来《基于质谱强度对肽浓度的定量蛋白质组学》。杨芃原教授的报告首先从MS强度和(包含同位素峰)/理论上应该发现的肽段数提出理论思考，在肽浓度和MS响应的校正曲线。

　　报告显示一系列理论支持和实验数据分析。qCONCAT的MRM分析，可一次表达超过20蛋白质对应肽段，并同时引进同位素标记;标准肽段和目标蛋白质酶切同步进行，可消除因样本制备过程带来的偏差。

华东师范大学廖鲁剑教授

　　来自华东师范大学的廖鲁剑教授上台作《应用稳定同位素为基础的定量质谱为神经系统疾病解码的路径》。廖鲁剑教授详细介绍了蛋白质定量方法，包括Metabolic labeling(SILAC、SILAM)、Chemical labeling(氧18)、Chemical labeling(iTRAQ、TMT、ICAT)和Label Free等蛋白质定量方法。

　　会议尾声，杨芃原教授上台作报告总结，并感谢每一位嘉宾的精彩演讲。

　　会后，CPSA创建者Mike Lee先生和New Objective公司总裁Gary Valaskovic博士与每一位演讲嘉宾合影留念。