【求助】放线菌的16s NCBI对比结果与多个菌种得分都是100...

最新回复

• 911 (2016-3-08 11:40:42)

  第一，NCBI里面结果不一定全部正确。第二，你要做另一个基因，做多基因分析！或者换基因

• u234 (2016-3-08 11:40:57)

  18s也测测

• 木槿 (2016-3-08 11:41:23)

  图是这样的

  
  bw460h1126809_1446046361_638.jpg

• 木槿 (2016-3-08 11:41:45)

  QUOTE:

  原帖由 911 于 2016-3-8 11:40 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')
  第一，NCBI里面结果不一定全部正确。第二，你要做另一个基因，做多基因分析！或者换基因

  有没有可能结果里面也是没有确定到种的菌种呀？

• 831226 (2016-3-08 11:42:00)

  只有第一条是个种，最起码可以确定是哪个属！参考一下該属鉴定文章，要是不重要倒属也就可以了
  

• 木槿 (2016-3-08 11:42:54)

  QUOTE:

  原帖由 u234 于 2016-3-8 11:40 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')
  18s也测测

  可不可以做理化性质实验之类的确定？这种实验复杂吗？

• #碧海潮生# (2016-3-08 11:43:09)

  也可以，但是太多了！菌种鉴定到种重要么？

• 911 (2016-3-08 11:43:27)

  继续进行生理生化鉴定才是正确的姿势~

• whitesheep (2016-3-08 11:43:47)

  如果初步鉴定，建议再扩增一个看家基因

• 木槿 (2016-3-08 11:44:09)

  QUOTE:

  原帖由 whitesheep 于 2016-3-8 11:43 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')
  如果初步鉴定，建议再扩增一个看家基因

  不好意思，看家基因是指的18s这些吗？

• 木槿 (2016-3-08 11:48:06)

  只有第一条是个种，最起码可以确定是哪个属！参考一下該属鉴定文章，要是不重要倒属也就可以了
  
  ===============================================================================================================
  
  倒数第四个是不是也是到种了？这样的话我是不是可以找到第一个和倒数第四个菌株的理化性质特点，然后做相应的实验在这两个菌株之间进行区分就行了呀？

• bhka (2016-3-08 11:48:30)

  不好意思，看家基因是指的18s这些吗？
  ...
  
  ===================================
  
  不是，你可以查一下，应该有不少的文献

• 45778 (2016-3-08 11:48:47)

  参见链霉菌MLSA多位点序列分析

• 45778 (2016-3-08 11:50:13)

  图是这样的
  
  ========================
  
  到哪个公司在做一下鉴定？

• any333 (2016-3-08 11:53:12)

  你是在做放线菌分新菌吗？是的话  我们可以交流交流。