雪貂基因组测序加深人类疾病研究
近日，一个国际研究团队进行了雪貂基因组测序,他们认为这将巩固雪貂作为研究人类呼吸道疾病如流感和囊性纤维化的生物模型。
研究人员检查了雪貂感染大范围流感病毒后基因随着时间推移的不同表达，通过研究囊性纤维化雪貂模型反映了人类疾病的发展。
基因分析中心的合著人Federica Di Palma在一份声明中表示“通过创建一个高质量的雪貂基因和转录组资源库,我们演示了如何通过对非常规模式生物的研究促进和巩固基础生物科学以及健康行业的发展。”
研究团队完成了对雌性黑貂的全基因组测序并通过ALLPATHS-LG处理得到了包括差异基因在内的2.41Gb数据。紧接着，他们使用Ensembl和两性雪貂21个组织中的24个样本的RNA-seq数据注释了所测得的雪貂基因组。研究人员通过结合他们所生成的样本RNA-seq数据和通用蛋白资源库中哺乳动物和其他脊椎动物的蛋白质序列进一步注释了雪貂蛋白质编码基因模型。
基于这些经过注释的雪貂蛋白质序列,研究团队构建系统发育树把雪貂归类在食肉动物犬科亚目之外。雪貂比啮齿类更早地从它们和灵长类动物的共同祖先中分化出来。因为啮齿类从其与灵长类的共同祖先中分化出来以后进化速度较快,基因组与灵长类差异逐渐增大，而雪貂进化较慢，具有比啮齿类动物更类似于人类的基因组。
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