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微生物菌种保藏有诀窍

2016.9.22

  目前,我国普通微生物菌种保藏中心保藏的ZL菌株为11977个,位列全球第2。

   一株在中国普通微生物菌种保藏管理中心沉睡了20年之久的古老菌种,最近因为韩春雨事件火了起来。这个叫做格氏嗜盐碱杆菌的菌种,在河北科技大学副教授韩春雨的利用下,实现了基因组编辑技术NgAgo-gDNA而出名。

   日前发布的《中国微生物资源发展报告2016》显示,世界各保藏中心共保有96907个用于ZL程序的生物材料,其中中国普通微生物菌种保藏中心保藏的ZL菌株为11977个,位列全球第2。

   9月14日,记者走进中国普通微生物菌种保藏管理中心(简称保藏中心),探寻微生物菌种的日常生活。

   支撑未来的“生命”银行

   中国普通微生物菌种保藏管理中心高级工程师辛玉华说,格氏嗜盐碱杆菌是20年前由中科院微生物所老所长周培瑾研究员从苏格兰交换来到中国,其最先分离于肯尼亚马加迪湖。作为保藏中心五千多种微生物中的一员,格氏嗜盐碱杆菌或通过真空冷冻干燥法,或借助-190℃左右的液氮超低温冻结法处于休眠状态。

   一些菌种甚至在冷藏室中沉睡了半个多世纪,“一旦有需求,它们就会被唤醒并投入应用。”辛玉华说。但如今,地球上99%的微生物人类还是不知道如何培养。只有经过培养,才知道它们未来能够做什么,并最终实现利用。

   “我们选择的菌种,一般要有潜在应用价值和丰富的生物多样性。现在,越来越多的微生物被‘唤醒’,并在各个领域一显身手。”辛玉华说。菌保中心保藏的微生物是经过几代人长期且持续累积来的,只有时间才能体现微生物资源保藏的价值。另外,微生物资源事关生物技术创新的未来。

   值得注意的是,今年5月,美国宣布启动“国家微生物组计划”,美国政府将在未来两年投入1.21亿美元作为启动资金,数十所大学和研究机构未来几年将投入4亿美元。

   菌种保藏有双重“保险”

   作为我国可同时提供一般菌种资源服务和ZL生物材料保存的国家级保藏中心,保藏中心于1995年被列入“布达佩斯条约国际保藏单位”,成为一个持有国际牌照的微生物“银行”。

   “这里主要是收集、保藏、鉴定、交换和供应各类生物材料。”辛玉华告诉科技日报记者,一些研发中分离出的菌种,暂时不知道有什么功能,就作为资源储备储存;而研究课题需要收集、筛选的菌类,结题后也可存放备份。几十年来,保藏中心共提供了几十万株各类微生物菌种,在我国生命科学和生物技术研发中贡献卓著。

   走进位于地下的保藏中心,空气中弥漫着丝丝凉气,和室外的闷热对比鲜明。在这间百十来平米的液氮生物储罐室中,放满了30来个容量为750升的“大罐子”,5.3万个如细菌、真菌、酵母等的微生物菌种暗藏其中。

   “几乎所有的菌种都贮存于液氮中,生物材料都先在这里保藏并‘备份’。”辛玉华提起一个液氮罐盖子,蒸腾着的氮气扑面而来,记者下意识的往后退了下。透过缭绕的雾气,各式各样的微生物菌种在小铁盒子里“睡大觉”。

   “液氮罐里的温度维持在-190℃左右,菌种在这里可以保存几十年。”辛玉华指着天花板说,当液氮变少时,楼上的“巨无霸”液氮罐会自动感应并及时添加,这些造价昂贵的“制冷剂”从天津直运而来。

   来到低温冷藏室,好像进了银行的保险库。一排排直抵天花板的不锈钢铁柜,每个柜子整齐排列着很多像“抽屉”般的隔间。拉出一个“抽屉”,就能看到很多支真空小玻璃管里存放着不同编号的菌种。试管中装有淡黄色、已经干燥处理的保护剂,藏在其中的是“休眠”中的微生物,这种保藏方法就被称为真空冷冻干燥法。

   经过双重“保险”保藏的菌种,一株菌售价只有500—1000元。作为公益性机构,保藏中心的价格不贵且质量有保证。值得注意的是,新的微生物物种需要经过保藏中心核实、保藏后才能在国际期刊生效发表,而这正是中国普通微生物菌种保藏中心具有的权威性。

   一个菌种的“生死”循环

   目前,保藏中心保存有各类微生物资源5700种、50000余株,用于ZL程序的生物材料有1万余株。那么,数目庞大的微生物资源,从“清醒”到被“沉睡”经历了什么?

   “菌种被送来后,首先进行存活度和纯度检测,然后用基因测定来核实菌种的正确性,继而用真空冷冻干燥法或液氮超低温冻结法保存菌种。”辛玉华说,保藏菌种时一般两种方法会互为备份,使用液氮法保存6份,真空法则要备份12个。

   “通过冷冻技术处理后,细菌就会处于休眠状态。如果要活化使用,则需通过相应的培养液进行活化,才能恢复活性。”辛玉华以格氏嗜盐碱杆菌为例说,复活菌种所需的营养为:20%的氯化钠,酪蛋白、氨基酸、pH值为9等,在适宜的温度和培养基中,这些沉睡的细菌便会被重新唤醒。

   ZL靠前但“短板”尚存

   如今,这里还保存着中科院微生物所送给毛主席的第一支灵芝菌种,有利于女性减肥的鼠李糖乳杆菌,还有可以减少田间施肥的同氮菌……

   科学家相信,当今时代人类面临的挑战,包括养活众多的人口、生产可持续的能源、保护环境或减缓对环境的破坏,以及人类健康等等,都与生物学相关,可以从微生物世界中找到解决方案。

   于是,越来越多的菌种被发现并唤醒后应用于人们生活。和其他知识产权ZL不同,微生物是唯一一种可通过ZL保护的生命形式,过去几年间,我国ZL微生物年保藏量增长速度一直位居世界第一。

   在保藏中心工作了20年的辛玉华坦言,自2000年以来硬件设施得到极大改善,如今这里拥有了全世界一流的实验设备。但记者在实验室看到,像氨基酸分析仪、λ35紫外可见分光光度计及PTP1温控系统、Qpix2全自动菌落挑取系统、变性高效液相色谱仪等必备高端设备,均产自德国、美国、日本;而国产的仅有普通冰箱、电磁炉、色谱仪等低端设备。

   “硬件设施和保藏技术都是国际先进,和国外的差距是菌种种类的多样性还不够丰富。”辛玉华介绍,美国典型菌种保藏中心为纯商业机构,菌种保藏的较全面、应用型也更强;德国微生物菌种保藏中心是欧洲规模最大的生物资源中心,细菌菌种保存见长;而半政府性质的荷兰微生物菌种保藏中心,真菌菌种最为齐全。

   “保藏中心一方面通过各种途径广泛收集新物种及新用途菌株,另一方面也与国外一流的菌保中心互相交换菌种,进而补充丰富菌种种类。”辛玉华说,此前世界微生物数据中心发表了全球微生物资源数据共享北京宣言,倡导重大微生物信息化国际合作计划,推动全球微生物资源信息化建设迈向新高度。

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