最新更新主题

【讨论帖】再谈核酸染料，最佳EB替代品

字体: 小 中 大 | 打印 发表于: 2015-7-02 15:45    作者: 黄花菜    来源: 分析测试百科网

查看完整版本请点击这里：
【讨论帖】再谈核酸染料，最佳EB替代品

相关疾病：
头痛
对于这个问题，实验室一直在讨论，各种核酸染料各有优缺，到底应该选择哪一个实在是个让人头疼的问题！
因为工作需要，我们室的核酸电泳量相当巨大，每天都要不停的跑啊跑。。所以对这个EB替代品问题就比较关心，基本上市面上的所有核酸染料都买来试过了。
其实做核酸电泳 替代EB的主要原因无非两条：
1 保证对身体低危害；
2 在不影响EB的效果的前提下，可以更加稳定，敏感度更高，以适应高精确度的实验
以这两条原则为准绳，我们做到现在，只有两个产品可以达到 sybr green ,和 gelred
无论是危害性，实验效果都可以达到要求。
但是鉴于实验室已经被污染，并且这两个产品的价格要比EB高出许多，所以现在仍然在使用EB。
想立刻更换EB替代品，希望大家根据自己的经验，给些建议，师弟在此不胜感激！
查看完整版本请点击这里：
【讨论帖】再谈核酸染料，最佳EB替代品

我也来说两句 查看全部回复

最新回复

  • 黄花菜 (2015-7-02 15:47:14)


    补充一个小知识，AO又称丫叮橙，剧毒致癌物质，也可以做DNA和RNA电泳。它在做双链DNA电泳时呈现绿色荧光，单链则为红色荧光。
    现在有不少国内EB替代品就是用AO(丫叮橙)为原料，实验效果虽然不如EB，这个暂且放在一边不说，就是毒性也够吓人的！无是从健康角度还是实验效果而言都无法与EB媲美！
    希望大家谨慎选择，剧我所知，国内的EB替代品，核酸染料全是用AO丫叮橙调制！
    因为所有的染料我都用过，这些国内的EB替代品，它们跟AO丫叮橙的实验结果惊人的相似！大家不妨都拿来试用一下看看结果。
    在毒性认证这方面我可以说我们应该很重洋媚外！
    没有人愿意拿自己5年甚至10以后的身体健康来做赌注

  • xyw5 (2015-7-02 15:47:35)

    我们实验室刚用sybr green 替代EB，可能是刚用条件不是摸的透彻，跑出的不如EB漂亮。
    请问你们使用sybr green 的步骤？
    不是要预染10MIN，染长时间有影响吗？
    实验室开空调，是否影响胶浓缩时间？

  • dog002 (2015-7-02 15:47:58)


    是不如eb漂亮，有时候还不准，跑一组，条带都成锯齿了，不过比ＥＢ敏感多了，用核酸染料染的也可以用凝胶成像仪看，也可以拍

  • dog002 (2015-7-02 15:49:26)


    电压越高，条带越乱，有时候会误认为是非特异性扩增，后又跑下ＥＢ，发现是目的条带，现在还没想出为什么．

  • 黄花菜 (2015-7-02 15:49:44)

    不同公司的sybr现在效果差别很大！产品相当乱。
    建议大家可以试试 gelred ,各方面效果都很出色，还可以免费试用的，不过不知道现在还发不发免费装

  • am10 (2015-7-02 15:51:20)

    补充一个小知识，AO又称丫叮橙，剧毒致癌物质，也可以做DNA和RNA电泳。它在做双链DNA电泳时呈现绿色荧光，单链则为红色荧光。
    现在有不少国内EB替代品就是用AO(丫叮橙)为原料，实验效果虽然不如EB，这个暂且放在一边不说，就是毒性也够吓人的！无是从健康角度还是实验效果而言都无法与EB媲美！
    希望大家谨慎选择，剧我所知，国内的EB替代品，核酸染料全是用AO丫叮橙调制！
    因为所有的染料我都用过，这些国内的EB替代品，它们跟AO丫叮橙的实验结果惊人的相似！大家不妨都拿来试用一下看看结果。
    在毒性认证这方面我可以说我们应该很重洋媚外！
    没有人愿意拿自己5年甚至10以后的身体健康来做赌注
    ......

    ============================

    看来以后接触goldview还是小心点好

  • mickeylin (2015-7-02 15:52:54)


    Ｇｅｌｒｅｄ是哪家公司买呢？价格多少？

  • mickeylin (2015-7-02 15:55:34)


    天根又推出了一个叫GeneGreen的染料,说是属于花青类染料,比EB毒性低,无致癌性,灵敏度比EB高10倍.紫外发射绿色荧光.拿了个试用装.不知道是不是楼上所说的AO(丫叮橙)?
    gelred价格是很高啊,将近一千块了.

  • mickeylin (2015-7-02 15:55:54)


    请问楼上是在哪申请的试用装？

  • 黄花菜 (2015-7-02 15:56:43)


    cuturl('www.probes.com.cn')
    很久以前的活动了，你自己找找看吧

  • 黄花菜 (2015-7-02 15:57:35)

    做电泳这么多年，其实还是EB最好，没毒就完美了

  • 黄花菜 (2015-7-02 15:57:52)

    强力推荐大家使用gelred，效果没的说，另外我看了报价，竟然比美金报价格还便宜，相当划算的EB替代品

  • feiya (2015-7-02 15:58:34)


    记得我们实验室用过赛百盛，跑的效果还是不错的。染DNA是绿色荧光，不知道和上面说的是不是一样的东西，我只知道商品名，呵呵

  • gogo (2015-7-02 15:58:51)

    我刚到实验室不久,听说是用一种叫"GENEFINDER"的EB替代品,不知道和以上大家说的有无联系,要是也有毒性的话我以后可要小心了.

  • feiya (2015-7-02 15:59:11)

    我现在还是从goldview用回EB了.没办法啊,EB灵敏度高而且便宜.安全自己多注意了,戴两层一次手套和一层橡胶手套可以了吧.

  • txwuyan (2015-7-02 16:00:41)

    其实我觉得核酸染料最好还是不要直接接触,不管现在有毒还是没毒的.
    因为从目前核酸染料的原理来讲,都是插入DNA,被刚性力束缚.当一定波长的光诱导以后,无法通过基团旋转来释放多余能量,只能通过电子的跃迁来平衡,所以发出荧光.
    还是少直接接触的好.

  • 黄花菜 (2015-7-02 16:02:26)


    The effective ingredient in GoldView is acridine orange (extremely cheap from Aldrich or Sigma at ~100g/$140!)
    Acridine orange is a known gel stain since 1970s (“Analysis of single- and double-stranded nucleic acids on polyacrylamide and agarose gels by using glyoxal and acridine orange”. Proc Natl Acad Sci U S A. 1977 Nov;74(11):4835-8.
    Acridine orange is a highly toxic and known mutagen!
    Selected list of papers on acridine orange toxicity:
    Web, RB. Mutat Res. 1984 Jul;137(1):1-6.
    Wugmeister, M. Yale J Biol Med. 1983 Jan-Feb;56(1):9-13.
    Martin, SE. Mutat Res. 1981 Jun;82(1):41-6.
    Ashad, R. Letters in Applied Microbiology 2006, 42:94.

  • 黄花菜 (2015-7-02 16:03:06)

    goldview ,genefinder等这些染料其实都是上边所说的 acridine orange （丫啶橙），毒性很大，如果大家现在用的是这两种东西就建议还是换回eb吧！！
    现在已经真相大白，
    建议不要再为节省那点银子而做无畏的牺牲了！！

  • junhun (2015-7-02 16:03:23)


    只要有上边所说的那个特性就应该是丫叮橙了，所以建议大家谨慎操作
    gelred价格是比较高的，奢侈的实验室才用的起了，不过送我们的试用装还没用完呢
    请问是哪个特性啊

  • 黄花菜 (2015-7-02 16:04:06)


    这个特性:
    它在做双链DNA电泳时呈现绿色荧光，单链则为红色荧光
查看全部回复 我也来说两句
查看完整回复请点击这里：
【讨论帖】再谈核酸染料，最佳EB替代品