【求助】总RNA提取不出来

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【求助】总RNA提取不出来
各位大虾!
本人准备做椎间盘的髓核的水通道蛋白的相关研究,但是组织的总RNA老是提不出来!要不就是总的NG数达不到要求,要不就是OD值达不到!跑的胶是一片空白什么东西也没有!我用了TRIZOL也达不到要求!
请帮忙分析一下原因!!!!谢谢
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  • baidukk (2016-2-08 21:42:37)

    个人认为提取RNA要注意几点:1)快速 尽管不要求你象百米赛跑一样快,但是也不能慢条斯理的,我们实验室的提取RNA的时候凡是离心的时候都是小跑进行的(因为离心机和操作台不在一个实验室),从取组织加液氮研磨开始到电泳检测条带都要快,最主要的目的当然还是尽量防止RNA的降解了。2)组织充分研磨 要使组织尽量研磨碎,匀浆化,这样更有利于细胞的裂解。为了尽量缩短时间,可以先用锤子先将组织锤碎,然后赶快加液氮,研磨,然后尽快加裂解液。匀浆化后室温静置的时间要足够,这样核蛋白复合物才能完全解离。3)操作要严格 尽量戴好口罩、帽子,每次操作的时候都尽量戴上手套,下一步操作的时候换一个手套,这样最大程度地避免RNA酶的污染。4)尽量离心都在低温离心机操作,但是如果你的操作够快,个人觉得也可以在常温离心机中操作,有段时间我们实验室低温离心机坏了就经常在常温离心机中提取RNA,一样能提取的很好,还有就是操作的时候也没必要在超净台中操作,就在一般的台子上就可以了,最好在离心机旁边,这样能最大程度的节约时间。5)时间要安排合理 比如在离心的时候就要准备好下一步用的东西,在提RNA之前就要倒好胶,在最后一步离心时就要准备好电泳的loading buffer,电泳时间最好15分钟内,电压高一点170v,总之是最大程度的避免RNA的降解了,祝你成功!
  • bring (2016-2-08 21:44:00)


    我的两点建议:首先,除试剂盒有特别说明的步骤外,整个过程应该尽量保证在冰上进行。其次,组织研磨过程我以为很重要,一定要快,而且要尽量避免此过程中标本温度升高。所以,选择一种最合适的研磨工具和步骤是很必要的。
  • 乌贼老弟 (2016-2-08 21:44:58)

    谢谢!
    操作应该没问题的啊!我请人家做过!还是没结果!用人家的TRIZOL还是没什么结果!真的很郁闷!!
  • 乌贼老弟 (2016-2-08 21:45:37)

    请问用液氮研磨有什么特别要求吗?
    我以前用的是匀浆器,可是组织不能完全研磨碎!
  • 乌贼老弟 (2016-2-08 21:47:14)


    是不是用液氮研磨后还得用匀浆器匀浆?我用液氮研磨后已经是粉态的了!
  • viviwang1987 (2016-2-08 21:47:32)


    我们的程序是加了trizol低温浸泡一段时间,然后用匀浆机在冰上匀浆。还有最后用洗RNA的时候一定要小心,很可能RNA丢失
  • cbou876 (2016-2-08 21:49:12)


    用液氮研磨后就可以了,目的是使组织块变小,便于后一步加trizol使核蛋白体完全分解。加入trizol后,要确保trizol中的组织不能成团,有结团的话要吹打均匀。另外,加异丙醇反应这一步,要混匀使rna与异丙醇充分反应,使其沉淀。我之前有过深刻的教训,因为没混匀,白白浪费了一个多月,最后才找到是这个原因。还有可能就是rna出来后,加入75%乙醇这一步,要注意先加750ul乙醇,后加250ulDEPC水。
  • 乌贼老弟 (2016-2-08 21:50:25)


    谢谢各位!
    我已经严格按说明书操作了,怎么还是提不出来啊!各位大侠有人用过PROMEGA的GV-total RNA isolution这个试剂盒吗?OD值为什么会出现负数啊?
    等待各位的解答!!!
  • standbyme (2016-2-08 21:51:21)


    我说几点建议:
    1.液氮研磨时,要随时加入液氮,我们磨一个样本要加3-4次液氮,并且要快速研磨。最好能有个人帮助加液氮!
    2.OD值出现负值……有可能是调零时没洗好吧!
    3.怀疑一下,你的样品保存中没出现什么问题吧?比如说融化了什么的,那样RNA就降解了,虽然这种错误很少有人犯,但是,不排除可能性啊!
    4.实验前的灭酶处理很重要,我们当时进行了好几天,剪刀镊子,研钵,饭盒,水,枪头,离心管……都用DEPC水泡了,然后高压,烘干,当时感觉可繁琐了,事实证明,前期工作做好了,后面会很省力的。
    我也是第一次做,一步步很谨慎的走,希望你能成功!
  • standbyme (2016-2-08 21:51:47)

    用液氮研磨后就可以了,目的是使组织块变小,便于后一步加trizol使核蛋白体完全分解。加入trizol后,要确保trizol中的组织不能成团,有结团的话要吹打均匀。另外,加异丙醇反应这一步,要混匀使rna与异丙醇充分反应,使其沉淀。我之前有过深刻的教训,因为没混匀,白白浪费了一个多月,最后才找到是这个原因。还有可能就是rna出来后,加入75%乙醇这一步,要注意先加750ul乙醇,后加250ulDEPC水。

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    为何要先加750ul乙醇,后加250ulDEPC水?有什么讲究么?
  • yyaxw84 (2016-2-08 21:53:06)


    我觉得你应该把你的详细步骤说出来让大家分析,既然你用别人的trizol和别人帮你做都没有做出来,我怀疑是不是你取材的时候没有注意,就是你在做实验之前,RNA已经降解了。如果是后面的实验步骤有些问题一般最后电泳都会看到降解的条带,不会什么都看不到。
  • standbyme (2016-2-08 21:54:07)


    我觉得你应该把你的详细步骤说出来让大家分析,既然你用别人的trizol和别人帮你做都没有做出来,我怀疑是不是你取材的时候没有注意,就是你在做实验之前,RNA已经降解了。如果是后面的实验步骤有些问题一般最后电泳都会看到降解的条带,不会什么都看不到。
    我这段时间提RNA 也是什么都没有,我的是霉菌,我想问一下,如果实验之前RNA已经降解了,电泳就什么都看不到吗?还是有降解带?谢谢
  • yyaxw84 (2016-2-08 21:54:31)

    一般做实验的过程只有1小时,如果你用新鲜的组织在一个小时里基本不会降解为单个的核苷酸,所以跑电泳还能明显看出5s或更小的亮带。要是你用保存不好的组织,有时候你的组织放在冰箱很长时间了,所以只要有RNA酶,一般就会降解成单个核苷酸了。这样跑电泳就什么都看不到了。
  • hold住 (2016-2-08 21:56:25)

    我是提细胞里的RNA,每次离心配平的时间都很长,是不是这段时间里RNA就给分解了?我用的是DEPC水配的酒精,高压之后用来洗RNA,行吗?
  • yyaxw84 (2016-2-08 21:58:34)

    QUOTE:

    原帖由 hold住 于 2016-2-8 21:56 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')
    我是提细胞里的RNA,每次离心配平的时间都很长,是不是这段时间里RNA就给分解了?我用的是DEPC水配的酒精,高压之后用来洗RNA,行吗?
    自己养的细胞应该还比较好提RNA,至少在你提之前它是活的。收集细胞的时候应该不会降解,因为你的细胞还在你的培养基里面,它还是有活性的。洗RNA的只要用DEPC水配就好了(但是乙醇最好是新开的),可以不用高压灭菌。
  • xueyouzhang (2016-2-08 22:00:08)


    你是怎么知道自己没提出来的?用rt-pcr来做pcr了吗?
    最后离心后能看到试管底部的白色羽状固体吗
  • baidukk (2016-2-08 22:01:28)


    把标本给我,我帮助你提取,不可能提不出来.
  • baidukk (2016-2-08 22:02:17)

    注意污染,注意降解,带口罩不说话,仔细操作,一般都没有问题。trozil进口最好,国产也行。稍微差点。
  • 乌贼老弟 (2016-2-08 22:03:48)

    谢谢.就是没提出来!!!
  • ROSE李 (2016-2-08 22:04:18)


    有没有邮箱?我给你一个液氮研磨的好方法。
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