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李瑞强:我和基因组有个约会

2014.11.03

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         北京市海淀区金码大厦的21层是一个与生命有关的"魔法现场",在这个2500多平方米的空间里,"生命魔法师"和他的200余名"魔法学徒"操弄着一系列神奇的"魔法器件",探寻着玄妙的生命奥秘。

  "魔法器件"各司其职:Agilent2100用于文库的检验和RNA质检,Qubit用于DNA质检,脉冲场电泳仪用于大片段文库构建检测DNA片段的完整性……这个"魔法现场"就是北京诺禾致源生物信息科技有限公司,负责"魔法现场"的"生命魔法师"就是董事长李瑞强。

  在大学期间攻读应用物理学的李瑞强,2002年毕业后就与生命科学结下了不解之缘。他先在全球最大的基因组研究中心--华大基因工作了8年,2011年开始担任北京大学生物动态光学成像中心、北大-清华生命科学联合中心、北京大学生命科学学院的研究员。在生物信息学与基因组学研究领域,李瑞强硕果颇丰,他先后参与主持了多项基因组研究计划的生物信息分析工作,从水稻基因组完成图、玉米核心种质测序,到大熊猫基因组、第一个中国人基因组图谱和国际千人基因组,凭借自己在业界的丰富经验,李瑞强成功入选"中关村高聚人才工程"和北京市第八批"海聚人才工程"。

  "这是一个每天都会让人充满好奇心并且投入到忘我的行业,每天都在与生命打交道啊!"李瑞强就像一个拆解生命的魔法师,乐在其中地洞悉着生命的瞬息万变。

  他在华大的8年,从生物信息研究部组长做到了主任,又变成副总裁,当人们都艳羡着他这份管理层美差的时候,他却毅然决定创业。"基因组学的发展非常迅速,并且越来越多地应用到其他领域。这样的背景下大有可为,错过了太可惜。"李瑞强坚持着自己的前瞻理念,不顾自己在华大基因的高层地位,于2011年3月在北京成立了诺禾致源生物信息科技有限公司。

  公司成立初期,面临的局面比预想中还要困难。"刚成立的时候,公司团队只有5个人,每个人都身兼数职,吃住都在公司。大家每天都为办理公司的各项手续和联系客户奔波不停。"李瑞强回忆说。

  经过不懈的努力,李瑞强和诺禾致源的团队终于争取到了公司的第一个大项目--藏猪基因组测序研究。"其实接下这个项目的时候,有些犹豫。因为公司刚刚成立,人手不够,实验平台也没有建立完全。在这样的条件下开展实验,会有一定的风险。但是,大家一起努力了那么久,好不容易有了项目,所有人都不想失去这个机会。"李瑞强说,"团队当时完全是'背水一战',为了完成好这个项目,大家都准备全力以赴。"

  为了保证项目质量,李瑞强决定找一个条件更好的地方开展实验。公司团队开始东奔西跑地寻找实验室。这其间,接洽的实验室有的条件合格,但协调起来时间不合适;有的协调顺利,但是实验条件又不过关。一番碰壁后,公司最终找到了中国农业科学院作物研究所的实验室来开展实验。

  "由于占用别人的资源,我们只能利用周末的时间工作,经常加班加点,熬着通宵做实验。"这来之不易的第一个项目最终得到客户的高度认可。

  这一研究利用高通量测序技术及生物信息分析策略,完成了一张精确完整的藏猪基因组序列图谱,从基因组水平揭示了藏猪特有的高原环境适应性的分子机理,通过重测序,首次对驯养猪和野生猪基因组进行了大规模的遗传变异分析,解析出四川盆地家猪在几千年的人工驯化过程中,基因组中重要经济性状相关基因的进化方向。不仅对保护我国地方优良猪种,促进生猪产业发展有重要的推动作用,更为研究人类高原缺氧性肺动脉高压、充血性心力衰竭、糖尿病和抗"光衰老"等提供了具有重要价值的线索。

  李瑞强以这个项目的研究结果,发表了题为《比较基因组学鉴定藏猪和家猪的自然和人工选择》的论文,并最终刊登在了国际著名学术杂志《自然》的子刊《自然-遗传》上。

  公司发展逐渐步入正轨,与其他研究机构的合作也日趋频繁。

  李瑞强告诉记者,为了探讨地山雀的分类问题,诺禾致源的研究团队与中国科学院动物研究所的研究人员一起,对地山雀进行全基因组测序。研究人员利用Illumina深度测序,组装出了长度为1.08Gb的地山雀基因组序列图谱,并对其近缘物种大山雀、黄颊山雀及黑尾地鸦进行重测序,从全基因组水平明确了地山雀的分类问题。这一研究,填补了高原鸟类基因组及分子生物学研究的空白,不仅为人们了解高原鸟类这一特殊种群提供了重要的遗传学和生物学基础,也为地山雀这种独有物种的保护提供了科学依据。

  在一次次的研究中,诺禾致源更加明确自己的研究方向,开始专注于开拓生物学、计算机科学和信息技术在动植物研究和人类健康领域的应用,完成了多个大型基因组项目研究。公司也被评为中关村国家自主创新示范区金种子企业、中关村高新技术企业等,获得了软件企业资质和北京市企事业ZL试点单位资质。

  "公司在中关村生命科学园区注册以后,先是获得了'留学人员创办企业开办费'的10万元资助,后来的科研项目又得到了'留学人员科技活动项目择优资助'的14万元补助。但其实当初创业的时候选择中关村,我更看重的是它的平台优势。正是在这里,公司开始越来越多地与外界接触,让大家逐渐认识了诺禾致源。"李瑞强说。

  现在,李瑞强的目光又看到了更远的未来:"虽然,目前高通量测序技术还大都用于科研领域,但测序技术的飞速发展和成本的进一步降低,会大大推动个体化医学和个人基因组时代的到来。到那时,基因组学技术在人类健康领域的应用将深刻改变现有的临床诊断和医疗健康模式乃至人们的生活方式。"

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