2010全国质谱大会大会报告(三)

2010-8-04 16:36 来源: 分析测试百科
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复旦大学 杨芃原教授

  来自复旦大学的杨芃原教授做了题为“糖蛋白结构的高通量质谱分析”的报告。杨教授介绍,由于理论的数据库大小是天文数字,使糖蛋白的结构分析成为目前糖蛋白分析瓶颈。杨教授在报告中介绍了用MALDI进行糖蛋白de-novo解谱,进而用ESI搜索糖蛋白数据库的糖蛋白结构鉴定方法。重点介绍了数据库是如何建立的。

  杨教授课题组的解决思路是,增加如多级质谱等各谱图阶段的信息(但由于质谱的速度和检出限,高通量使用尚有问题),减少检索时所需的已知信息,创建高可信度的糖肽数据库,并撰写新的检索软件。具体方案为:1)建立完备、精简的包含糖位点的肽库及糖链库,通过实验获得肽库,根据文献获得糖链最大组成的糖链库,穷举它们的结构后,再人工排除不合理结构,获得针对特定样品的糖链库。2)构建针对特定样品的糖结构库。3)筛选出谱图中可能的糖碎裂峰。4)对碎裂峰进行匹配,获得糖肽组成,使用上一步骤获得峰连续碎裂网络,对网络中的多个路径进行批量分析,再根据解的重复性判断可靠性。杨教授还通过实例向大家讲解了具体的糖蛋白结构确定过程。

中国科学院上海药物研究所 上海中药现代研究中心 果德安研究员

  来自中国科学院上海药物研究所、上海中药现代研究中心的果德安研究员,做了题为“液质联用技术在中药分析中的应用”的报告。果老师近几年主要从事中药标准的制定和质量控制工作。传统的中药质控方法无法分析复杂系统,报告中,果老师从中药质控的角度讲述了液质联用技术的应用。通过丹参、灵芝、黄芪、连翘的分析实例,证明液质联用的方法比传统的方法好得多,目前正在向全成份分析过渡。最后,果老师指出,质谱在中药复杂体系中有广阔的应用空间。

AB Sciex公司 刘麟先生

  来自AB Sciex公司的刘麟先生,做了题为“生物质谱深入解析蛋白质——鉴定、确证与定量化分析的完整解决方案”的报告。报告中,刘先生重点介绍了AB SCIEX于今年5月在ASMS上推出的AB SCIEX TripleTOF™ 5600系统,该系统第一次在一个平台上,实现了同时具有三重四极杆的典型定量能力、高分辨和精确质量系统的定性能力。刘先生介绍,TripleTOF 5600系统为科学家们设计了新型、更好的方式来进行质谱实验,该系统可应用在诸如新药发现、生物标志物检测、以及食品安全和环境分析等广阔范围的生命科学应用中。

  AB SCIEX TripleTOF 5600系统具有一系列的新的创新技术,包括:1)智能高速(SmartSpeed™)的100 Hz采集速度——至少是其它高分辨质谱5倍以上的速度;2)加速器飞行时间分析器(Accelerator TOF™ Analyzer)——在高速度和工业级的灵敏度下具有高分辨能力;3)简便质量校准(EasyMass™ Accuracy)——可获得稳定的约1 ppm的质量准确度,却不需要用户持续的校准。4)相比于市场上现有的精确质量测定质谱,这些特性展示了显著的技术进步,原先的系统在定性时需在速度和灵敏度之间取得平衡,在准确定量时又要在重现性和精密度之间取得平衡。

  此外,刘先生还介绍了与TripleTOF 5600同时发布的一系列特色的应用软件:用于在药物研究中鉴定代谢物的代谢物导航(MetabolitePilot™)软件、用于快速和简便地处理和显示大量的质谱数据的峰观测(PeakView™)软件、用于简化小分子和大分子的定量流程的多组分定量(MultiQuant™)软件、用于简化蛋白质组学研究的蛋白导航(ProteinPilot™)软件以及用于脂质组学研究的脂类观测(LipidView™)软件和用于代谢组学和生物标志物筛选分析的标志物观测(MarkerView™)软件。

美国华盛顿大学 Han, Xianlin(韩贤林)教授

  来自美国华盛顿大学的Han, Xianlin(韩贤林)教授,做了题为“New Development of MALDI-MS on lipid analysis”(用MALDI-MS分析脂质的新发展)报告,在报告中他谈到,MALDI-MS技术在蛋白质组学中广泛应用,但在脂质组学应用中遇到很多挑战,比如高的基质背景、严重的离子抑制、严重的源后解离、脂质点明显的不均匀分布等。最近科学家们发展了一系列方法来克服这些缺点。比如新技术(薄层点MALDI-MS),新应用(直接成像组织中的脂质),新基质(如9-aminoacridine(9-AA))。该报告综述了这些进展,并重点介绍了应用9-AA于脂质组学分析的研究。研究发现,9-AA作为MALDI-MS分析基质很有优势,可减少基质背景,减少源后解离,提高离子化效率(特别是负离子模式),提高一些族系脂质的灵敏度(如sulfatide)。课题组用该方法(9-AA为基质的MALDI-MS分析)分析了许多族系的脂质,并与“金标准”定量法的ESI-MS定量法做了比对。以下是英文摘要:

  The power of matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry (MALDI-MS) in proteomics is well recognized. However, its application for lipidomic analysis has been hampered due to a number of caveats including high matrix background, severe ion suppression, serious post-source decay, and apparent inhomogeneous distribution of lipids at spots.

  Recently, great efforts have been made to address these drawbacks. A number of developments in this area have been made, including new techniques (e.g. TLC-blot-MALDI-MS), new application (e.g. direct profiling and mapping of lipids from tissues), and new matrices (e.g.,9-aminoacridine(9-AA) ). These new developments are outlined in presentation.

  The emphasis of this work is on the application of 9-AA on lipidomic analysis as we have recently conducted. We have found that 9-AA as matrix for MALDI-MS analysis of lipids offers a number of advantages over essentially all other matrix used in the literature, including minimal matrix background, reduced post-source decay, enhanced ionization efficiency (particularly in the negative-ion mode),and increased sensitivity for certain lipid classes (e.g.,sulfatide). We have also demonstrated that many classes of lipids can be directly analyzed from a lipid extract of a biological sample and the spectra acquired by MALDI-MS with 9-AA as matrix are comparable with those obtained from electrospray ionization MS which has recently been used as a “golden standard” for quantitative analysis of lipids. Collectively, the recent developments of MALDI-MS provide new sprints for lipidomic research.