2010全国质谱大会大会报告（三）
复旦大学 杨芃原教授
来自复旦大学的杨芃原教授做了题为“糖蛋白结构的高通量质谱分析”的报告。杨教授介绍，由于理论的数据库大小是天文数字，使糖蛋白的结构分析成为目前糖蛋白分析瓶颈。杨教授在报告中介绍了用MALDI进行糖蛋白de-novo解谱，进而用ESI搜索糖蛋白数据库的糖蛋白结构鉴定方法。重点介绍了数据库是如何建立的。
杨教授课题组的解决思路是，增加如多级质谱等各谱图阶段的信息（但由于质谱的速度和检出限，高通量使用尚有问题），减少检索时所需的已知信息，创建高可信度的糖肽数据库，并撰写新的检索软件。具体方案为：1）建立完备、精简的包含糖位点的肽库及糖链库，通过实验获得肽库，根据文献获得糖链最大组成的糖链库，穷举它们的结构后，再人工排除不合理结构，获得针对特定样品的糖链库。2）构建针对特定样品的糖结构库。3）筛选出谱图中可能的糖碎裂峰。4）对碎裂峰进行匹配，获得糖肽组成，使用上一步骤获得峰连续碎裂网络，对网络中的多个路径进行批量分析，再根据解的重复性判断可靠性。杨教授还通过实例向大家讲解了具体的糖蛋白结构确定过程。
中国科学院上海药物研究所 上海中药现代研究中心 果德安研究员
来自中国科学院上海药物研究所、上海中药现代研究中心的果德安研究员，做了题为“液质联用技术在中药分析中的应用”的报告。果老师近几年主要从事中药标准的制定和质量控制工作。传统的中药质控方法无法分析复杂系统，报告中，果老师从中药质控的角度讲述了液质联用技术的应用。通过丹参、灵芝、黄芪、连翘的分析实例，证明液质联用的方法比传统的方法好得多，目前正在向全成份分析过渡。最后，果老师指出，质谱在中药复杂体系中有广阔的应用空间。
AB Sciex公司 刘麟先生
来自AB Sciex公司的刘麟先生，做了题为“生物质谱深入解析蛋白质——鉴定、确证与定量化分析的完整解决方案”的报告。报告中，刘先生重点介绍了AB SCIEX于今年5月在ASMS上推出的AB SCIEX TripleTOF™ 5600系统，该系统第一次在一个平台上，实现了同时具有三重四极杆的典型定量能力、高分辨和精确质量系统的定性能力。刘先生介绍，TripleTOF 5600系统为科学家们设计了新型、更好的方式来进行质谱实验，该系统可应用在诸如新药发现、生物标志物检测、以及食品安全和环境分析等广阔范围的生命科学应用中。
AB SCIEX TripleTOF 5600系统具有一系列的新的创新技术，包括：1）智能高速（SmartSpeed™）的100 Hz采集速度——至少是其它高分辨质谱5倍以上的速度；2）加速器飞行时间分析器（Accelerator TOF™ Analyzer）——在高速度和工业级的灵敏度下具有高分辨能力；3）简便质量校准（EasyMass™ Accuracy）——可获得稳定的约1 ppm的质量准确度，却不需要用户持续的校准。4）相比于市场上现有的精确质量测定质谱，这些特性展示了显著的技术进步，原先的系统在定性时需在速度和灵敏度之间取得平衡，在准确定量时又要在重现性和精密度之间取得平衡。
此外，刘先生还介绍了与TripleTOF 5600同时发布的一系列特色的应用软件：用于在药物研究中鉴定代谢物的代谢物导航（MetabolitePilot™）软件、用于快速和简便地处理和显示大量的质谱数据的峰观测（PeakView™）软件、用于简化小分子和大分子的定量流程的多组分定量（MultiQuant™）软件、用于简化蛋白质组学研究的蛋白导航（ProteinPilot™）软件以及用于脂质组学研究的脂类观测（LipidView™）软件和用于代谢组学和生物标志物筛选分析的标志物观测（MarkerView™）软件。
美国华盛顿大学 Han, Xianlin（韩贤林）教授
来自美国华盛顿大学的Han, Xianlin（韩贤林）教授，做了题为“New Development of MALDI-MS on lipid analysis”（用MALDI-MS分析脂质的新发展）报告，在报告中他谈到，MALDI-MS技术在蛋白质组学中广泛应用，但在脂质组学应用中遇到很多挑战，比如高的基质背景、严重的离子抑制、严重的源后解离、脂质点明显的不均匀分布等。最近科学家们发展了一系列方法来克服这些缺点。比如新技术（薄层点MALDI-MS），新应用（直接成像组织中的脂质），新基质（如9-aminoacridine(9-AA)）。该报告综述了这些进展，并重点介绍了应用9-AA于脂质组学分析的研究。研究发现，9-AA作为MALDI-MS分析基质很有优势，可减少基质背景，减少源后解离，提高离子化效率（特别是负离子模式），提高一些族系脂质的灵敏度（如sulfatide）。课题组用该方法（9-AA为基质的MALDI-MS分析）分析了许多族系的脂质，并与“金标准”定量法的ESI-MS定量法做了比对。以下是英文摘要：
The power of matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry (MALDI-MS) in proteomics is well recognized. However, its application for lipidomic analysis has been hampered due to a number of caveats including high matrix background, severe ion suppression, serious post-source decay, and apparent inhomogeneous distribution of lipids at spots.
Recently, great efforts have been made to address these drawbacks. A number of developments in this area have been made, including new techniques (e.g. TLC-blot-MALDI-MS), new application (e.g. direct profiling and mapping of lipids from tissues), and new matrices (e.g.,9-aminoacridine(9-AA) ). These new developments are outlined in presentation.
The emphasis of this work is on the application of 9-AA on lipidomic analysis as we have recently conducted. We have found that 9-AA as matrix for MALDI-MS analysis of lipids offers a number of advantages over essentially all other matrix used in the literature, including minimal matrix background, reduced post-source decay, enhanced ionization efficiency (particularly in the negative-ion mode),and increased sensitivity for certain lipid classes (e.g.,sulfatide). We have also demonstrated that many classes of lipids can be directly analyzed from a lipid extract of a biological sample and the spectra acquired by MALDI-MS with 9-AA as matrix are comparable with those obtained from electrospray ionization MS which has recently been used as a “golden standard” for quantitative analysis of lipids. Collectively, the recent developments of MALDI-MS provide new sprints for lipidomic research.
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