Nat Commun:科学家成功绘就大鼠基因功能图谱

2014-4-02 09:15 来源: 中国科学报
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11种器官和4个发育阶段的大鼠基因功能图谱被成功绘制

        记者从复旦大学获悉,该校药学院石乐明课题组与美国食品药品监督管理局国家毒理学研究中心、洛马林达大学等单位合作,成功绘制出涵盖11种器官和4个发育阶段的大鼠基因功能图谱。相关成果日前发表于《自然—通讯》杂志。

  据介绍,大鼠是一种被广泛应用于研究人类疾病及治疗方法的重要模式生物,但有关大鼠本身的研究工作并未获得很大进展。这主要表现在学界对大鼠的遗传密码、基因图谱等对象的研究仍不完整,对大鼠的基因功能等缺乏科学、权威的解释。

  此次研究人员运用RNA测序技术,对一种被广泛用于药物安全性评价研究的“Fischer 344大鼠”的幼年、青春期、成年及老年的基因进行测试,最终绘制出目前世界上最完整的大鼠基因功能图谱。据了解,该测试涵盖11种器官的320个样本。

  为证明该图谱的可靠性,石乐明课题组专门验证了美国一著名专业基因功能数据库(AceView)以往所注释的众多有生物功能的基因,并绘制出40064个基因和65167种有生物功能的基因变种的表达谱。他们发现,大鼠拥有大量人类以前并未认识的功能基因,且其组织与组织之间所表达的基因数量不同,不同年龄段基因数量不同,雌雄之间组织器官表达的基因数量和功能也不同。

  他们还发现,有些基因在不同情况下会发挥不同作用,如一些基因只在某些特定的组织器官、不同年龄段以及不同性别的大鼠身上发挥作用。

  业内专家认为,该成果对药物安全性评价和个性化医疗有重大意义。