2010年8月23日，受国家发改委委托，中国国际工程咨询公司（以下简称“中咨公司”）在北京永兴花园饭店组织召开了国家蛋白质科学基础设施―北京基地(凤凰工程）建设项目可行性研究报告（以下简称“可研报告”）评估会。总后卫生部、国家教育部、中国科学院、北京市发改委和昌平区发改委的有关领导出席了会议。中心主任、军事医学科学院院长贺福初院士、院科技部徐天昊副部长、院务部任华林副部长、二所杨晓明所长、清华大学陈吉宁常务副校长、生命科学学院院长施一公教授、北京大学林建华常务副校长、生命科学学院院长饶毅教授、中科院生物物理所许瑞明副所长等出席了此次会议。
专家组认真听取了军事医学科学院、清华大学、北京大学、中科院生物物理所等建设单位和可研报告编制单位中国中元国际工程公司的汇报，并与出席会议的建设单位的领导和专家进行了充分的交流。专家组认为，凤凰工程是在国家层面统一部署、集中建设的大型基础设施，是开展大规模蛋白质研究与开发，抢占生命科学研究战略前沿必要的基础条件，其建设符合《国家中长期科学和技术发展规划纲要（2006―2020年）》总体部署要求。