【求助】磷酸化蛋白WB结果不是非特异条带就是白板


最近一直做一种酪氨酸磷酸化蛋白,电泳、转膜基本没有问题,试过5%脱脂奶粉和5%BSA封闭2h,一抗(CST,5%BSA-TBST配,推荐1:1000)做了几个梯度1:1000,1:2000,1:4000,二抗(博奥森,配法同一抗)1:4000,1:5000,洗膜都是10min*4次,ECL显色,压片最长1h,结果如下:
5%脱脂奶粉封闭2h-一抗1:2000,二抗1:4000,-泳道样的非特异性条带,但是目的蛋白大小的条带较浓
5%BSA封闭2h-一抗1:4000,二抗1:5000-白板
5%BSA封闭5h-一抗1:1000和1:2000,二抗,1:5000-几乎是白板,不过能看到泳道样的轮廓
看过真多相关的帖子还是很迷惑啊
请教各位前辈,尤其是有过类似经验的前辈们,怎么样才能得到理想一点的结果呢?我要调整封闭时间还是抗体比例?谢谢!在线等啊

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最新回复

  • fei1226com (2013-12-18 15:15:44)


    我不是有经验的同学,但我觉得你要调抗体浓度,试着把二抗浓度加大点,不要一抗二抗同时稀释,那样你就发现不了是谁浓度的问题了。或者用脱脂奶封闭,二抗用1:5000试试。我一般封闭一个小时就可以的,我用的是脱脂奶,但后来有一个蛋白出的不太好,我也在寻找帮助呢
  • shenkunjie (2013-12-18 15:16:50)


    谢谢!
    之前很多人都说用BSA封闭更好,所以我后几次用的都是BSA,不知道你用脱脂奶1h也是磷酸化蛋白吗?二抗1:5000不变,一抗不同梯度都几乎是白板。
  • shenkunjie (2013-12-18 15:19:54)

    请问谁还有好的建议吗?我实在不知道怎么下一步怎么改变条件了
    之前帖子上有人说“封闭液封闭时间不宜过长,否则会置换掉膜上的蛋白”,请问这种说法对吗?
  • yjf1026 (2013-12-18 15:20:13)


    你用牛奶封闭的时候,有出条带,那你应该尝试一下使用牛奶的情况下,分别降低一点一抗和二抗浓度会不会有条带。比如你可以做两次这样的:
    1,5%牛奶,一抗1:3000,二抗1:4000
    2,5%牛奶,一抗1:2000,二抗1:5000
    对于特定的蛋白,用牛奶和用BSA常常会出现不同的结果。
  • shenkunjie (2013-12-18 15:22:02)

    之前试过你说的第二种方法,不过当时压了30min白板就没继续延长时间。
    今天3%BSA,2h,一抗1:2000,二抗1:5000,结果marker也曝出来了,非特异性条带比目的条带深很多,考虑是不是应该封闭过夜,并且提高一抗浓度才行?
  • ladyhuahua (2013-12-18 15:22:31)


    我做的是磷酸化蛋白,脱脂奶封闭1小时。
    我觉得你可以继续稀释下二抗的浓度,一抗就用1:2000。如果目的条带不是很浅可以不换一抗浓度。还有就是你做的是组织还是细胞,有时候蛋白提取不好时做的条带也不好,蛋白提取也很重要。如果都没问题,建议你换用一下二抗试试,找其他同学的好的二抗试用一下。
  • shenkunjie (2013-12-18 15:23:29)


    结果还是不理想,郁闷ing~
    3%BSA 4度过夜,一抗1:2000 4度过夜,TBST10*4,二抗1:5000,RT 30min,TBST10*5,结果还是有maker显色,奇怪的是一张膜上一些目的条带和非特异性条带同时出现,另一些基本什么都没有,不知道什么原因?
    难道真的如楼上 战友说的蛋白提取有问题?
  • 小糖块 (2013-12-18 15:36:30)


    以前我也做过磷酸化蛋白WB,封闭1小时,没问题的也没杂带.个人觉得上面说的蛋白制样和抗体的问题值得考虑.国内抗体就没国外的好
  • H2O (2013-12-18 15:38:54)


    据说磷酸化的蛋白很容易脱磷酸化,所以样品一定要新鲜的,一般是一周以内的。不知是否准确?
  • shenkunjie (2013-12-18 15:43:29)


    抗体是CST的,质量应该没问题;样品的确不新鲜了,因为做的是师姐留下的组织蛋白,有好几个月了,不过是加了裂解液(含NaF,Na3VO4)放在-70保存的。
  • kuohao17 (2013-12-18 15:49:07)


    我的建议是既然你可以做出来目的条带,而且比较深,那么基本就是封闭的问题了,上面看到你的封闭液,那么你可以试试同时加bsa和脱脂奶粉的配方,就是说可以用含3%bsa和2%脱脂奶粉的封闭液试试,或者其他的组合。有些蛋白就需要这样的封闭液才能出好的结果。一抗1:2000, 二抗1:5000应该没有问题,做出来结果及时反馈,我们再商量。
  • yonger (2013-12-18 15:49:41)


    我感觉就是你的蛋白问题了,存放那么久了。忘了问,你的内参出的好吗?如果内参都不好就肯定是蛋白的问题了。如果再不理想,你可以试着取点新鲜标本试试
  • yonger (2013-12-18 15:49:57)


    marker显色说明你的转膜和抗体没问题,但目的蛋白没出来我感觉就是目的蛋白的问题了
  • 3N4G (2013-12-18 15:50:59)


    应该是蛋白的问题,呵呵,建议重提,提的时候要多加小心:)祝实验顺利
  • jujuba (2013-12-18 15:52:57)


    我做过酪氨酸磷酸化蛋白STAT1的WB, 个人感觉一抗一般不会有什么问题,关键是蛋白的制备,要用酪氨酸蛋白酶抑制剂,普通的方法是做不出来的
  • tangxin_80 (2013-12-18 15:53:18)


    我觉得你的二抗只抚育30分,好象短吧,我的都抚育2小时的,而且磷酸化结果很好.
  • greenbee (2013-12-18 15:53:44)

    我也在做磷酸化酪氨酸蛋白的WB,有时候同样出现你所说的问题。我做的是组织的蛋白,不知道你的蛋白是细胞的还是组织的。我们的经验和处理方式如下:
    1 磷酸化酪氨酸蛋白极容易降解,所以,在制备组织样本的时候需要注意加入多种磷酸酶的抑制剂: 我们加入的蛋白酶抑制剂的种类比较多,包括protein inhibitor II和III(Merck产品),矾酸钠、甘油磷酸钠等,此外,裂解液中还加入还原剂DTT。即使是这样,我们的结果还是不太稳定,教授和国外的同行就结果讨论了很多次,最后反复修改蛋白的处理方法,现在结果已经相对好了很多。所以,如何保持组织的磷酸化蛋白不被降解是WB的前提和关键所在。
    2 抗体:我们用的抗体是Upstate的4G10 anti-phosphotyrosine抗体,即使如此,结果也是一般般,有时候好,有时候就是白板。就在昨天,教授已经下令让我寻找了多家公司的抗体,最终没有办法,还是重新订购了Upstate的同一种抗体(原因是教授认为国内的公司在运输抗体的过程中可能会出现问题,从而导致抗体的效度出现误差,即使是同一家公司)。另外晶美公司有代理Souther Biotech的抗磷酸化酪氨酸抗体,但是由于不是4G10(被认为是金标准),虽然价格很便宜910元,我们还是选择了Upstate。
    综合上述,你可以考虑下你的样品制备和抗体。
    如果需要样品裂解液的配方,可以PM我^_^
  • 喵咪 (2013-12-18 15:54:08)


    在学习中成长,我通过学习各位的见解:1。磷酸化的蛋白样品不稳定,请确保样品可靠性,最好正确使用新近制备的样品。
    2.拿到一抗、二抗请及时分装保存使用,二抗建议你使用另外的公司,我用过博奥森的二抗,耽误我半年时间,我始终认为是自己问题,后来换了博士德的抗体,问题解决了;建议你:如果老板有钱就买原装进口的二抗(千万不要用分装的),如果老板没钱可以买博士德的。
    3.建议你摸条件的时候设计好逐层改变条件,最好同时进行平行实验,从你提供的实验结果来看,我觉得二抗的浓度问题不大
  • u234 (2013-12-18 15:54:38)

    大家好!
    我用同样的蛋白样品,5%BSA封闭2h,一抗1:2000 4度过夜,TBST10*4,二抗(换别人的,北京中衫)1:5000,RT 30min,TBST10*5,结果终于好很多,目的条带比较明显,基本没有背景,不过还是有浅的非特条带,看来是博奥森的二抗太差了!考虑这两天再优化一下实验条件。
    感谢各位战友这些日子对我的帮助!
  • tie8 (2013-12-18 15:55:04)


    恭喜您结果有所改善,能否将您结果前后对比的图贴出来,再分析下是否确实是二抗的原因。