该发现构成了描述表观基因组的新框架

荷兰科学家在果蝇细胞中发现五种主要染色质类型

　　转录活性常染色质与受阻遏异染色质的染色质传统分类曾是一个有用的模型，但它应该进行升级，以适应人们日益增加的有关染色质功能域的知识。一项在果蝇中对与蛋白质有关的53种染色质进行的大规模综合性全基因组分析表明，染色质有五种主要类型；这些可以构成描述表观基因组的新框架。

　　阿姆斯特丹市荷兰癌症研究所的Guillaume J. Filion和同事从染色质蛋白质组中选择了一组宽泛的蛋白质，并利用DamID方法在一个胚胎果蝇细胞株中绘制了它们的基因组位置。在这项技术中，每种感兴趣的蛋白质都被混合了DNA腺嘌呤甲基转移酶（Dam），它利用一个甲基腺嘌呤足迹标记了蛋白质—DNA的相互作用位点。研究人员随后利用一种数据驱动的计算分类策略在整个基因组中鉴别出了周期性的、完全不同的蛋白质组合。基因组区域——长度从1kb变化到100多kb——通过它们的蛋白质信号而分成了5个清晰的类别，并且研究人员给每一个类别赋予了一个有颜色的名字。