国内首个乙肝病毒基因多功能共享数据库建成

2011-5-03 15:10 来源: 科技日报
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  近日,国内首个乙型肝炎病毒基因多功能共享数据库在解放军302医院建成并投入使用,其收录了我国10000余例患者乙型肝炎病毒基因序列、基因克隆和相关临床资料,具有较强的生物信息学分析功能,为研究我国患者乙型肝炎病毒基因变异与耐药、分子致病机制、疫苗设计和免疫应答等提供了共享信息平台,也可为临床合理制订抗病毒治疗方案提供帮助。

  据全军传染病研究所副所长、解放军302医院徐东平研究员介绍,这个数据库具有序列数据量大、数据资源免费共享的特点,并可系统地检测和监控核苷(酸)类抗病毒药物耐药变异;此外,该数据库还在不断收录新的病例资料和序列信息,具有可扩充性。该数据库目前已收录了2000多个代表性病毒基因克隆,收录了耐药变异、抗病毒药物治疗和临床应答指标等相关信息。

  数据库具有多种实用生物信息学分析功能,包括序列相似性比对、基因亚型分析、HBV血清型分析、核苷类似物耐药位点分析、特异性T淋巴细胞表位分析、病毒基因组系统进化树分析以及个性化数据筛选分析功能,能从核酸和蛋白两个层次,对HBV各个功能区不同长度的序列多态性进行统计。数据库已在多家医疗与科研单位进行了应用,取得了预期效果,目前已正式联网运行。