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【求助】QPCR加样及数据处理问题
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刚接触QPCR相对定量分析方法,有几个问题超级迷茫,希望各位大侠给予帮助,谢谢!
1、内参跟目的必须要在同一个体系内吗?可不可以分开做?因为分组太多,一起做的话,PCR仪上的孔不够呀!那我应该怎么做呢?
2、我做的是肿瘤小鼠用不同药物处理取组织检测有无基因表达差异,这样的话,我数据处理的时候,应该以哪个组作为校准样本呢,因为校准样本的2∧ΔΔCT数值得出就是1,没有办法进行数据统计,这不就等于少算了一个组吗?(写的很麻烦,希望有人看得懂!)就像下图中组1的情况!
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最新回复
49888 (2015-8-03 17:08:03)
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ROSE李 (2015-8-03 17:10:21)
49888 (2015-8-03 17:11:37)
别的组得出来的结果不是范围啊,就是一个数值;
你运用2-ΔΔCT法本来就是相对定量法,所得结果是实验组相比对照组目的分子的相对表达倍数,对照组的数据本身并没有消失啊,只是相当于变为“1”了。。。
xingyi08 (2015-8-03 17:12:04)
你运用2-ΔΔCT法本来就是相对定量法,所得结果是实验组相比对照组目的分子的相对表达倍数,对照组的数据本身并没有消失啊,只是相当于变为“1”了。。。
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不是数据处理的之前,是三次重复试验,每次三个平行样的嘛,所以到时候出来的肯定不是一个数值,而是一个区间啊,是吧
49888 (2015-8-03 17:13:07)
ROSE李 (2015-8-03 17:13:41)
QUOTE:
哦,好吧!可是看人家文献上都有一个区间范围的,不知道怎么得来的ROSE李 (2015-8-03 17:14:20)
你是说对照组的量如果看成是1,它的标准误的bar是怎么算出来的是吗?
一种方法是:因为同一实验要重复3次,你把3次实验对照组的2-DeltaCt的均值看作1,每次实验的2-DeltaCt值和这个均值算标准误,不就有浮动区间了吗?
然后,3次试验组的DeltaCt都要减去对照组的DeltaCt均值,再算2-DeltaDeltaCt。
不知我说明白了没有,说的对不对?
newway (2015-8-03 17:14:35)
ns5fan (2015-8-03 17:16:26)
对照组好像就应该是1,没有标准误,大老板是这么说的。重复试验没次都是以对照组为参照,它每次都是1
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