经历过长期人工选育的具有独特性状的作物优良品种很可能固定了一些在祖先基因库中以低频状态存在的优质等位基因 (elite
allele)。这些优质等位基因贡献了该优良品种的优良农艺性状。在传统的遗传学研究中，科学家使用数量性状位点连锁作图(Quantitative trait
loci linkage mapping)或关联作图(association
mapping)的方法定位农艺性状相关基因。但是，连锁作图需要耗费长时间构建分离群体，而关联作图对于群体中以低频状态存在的等位基因缺乏定位的功效。
为了高效快速地鉴定优质品系中的优质等位基因，中国科学院昆明动物研究所遗传资源与进化国家重点实验室马普进化基因组学青年科学家小组的博士研究生吕俊在导师王文研究员的指导下，通过与云南省农业科学院、深圳华大基因研究院合作，提出一种新的鉴定改良品系中优质等位基因的方法——改良品系标签位点分析(Elite
variety tag SNP analysis, ETAS analysis)。