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JCB:发布细胞生物学“Google地图”

2012.8.06

  通过Google地图我们动动鼠标就可以从地球全景图拉近到自家后院,近日荷兰Leiden大学医学中心的科学家们在Journal of Cell Biology杂志上发布了细胞生物学的“Google地图”,并将其称为虚拟纳米显微镜。现在人们可以通过该成果从整个胚胎的生物组织全景放大到各个亚细胞结构进行观察,这都要归功于近年来电镜和图像处理技术的发展。您只需要升级到JCB基于浏览器的图像显示工具JCB DataViewer (http://jcb-dataviewer.rupress.org),就可以取得这些公共数据资源用于研究。

  早在细胞生物学的初期,电镜就帮助人们揭示了细胞的精细结构。不过这一技术也存在局限,因为高分辨率电镜观察只能在一张图像中捕捉到细胞的一小部分,使研究人员很难将观察到的结构与细胞整体关联起来,更不必说细胞所处的组织或器官了。而另一方面,以较低的分辨率观察样品能得到细胞或组织的较大图像,但又不能同时观察到精细的亚细胞结构。

  现在Leiden大学医学中心的Frank G.A. Faas等科学家们解决了这一问题,他们开发了新工具将成千上万的电镜图像结合在一起形成了生物组织的高分辨率图像,人们可以通过新版JCB DataViewer查看他们的数据。

  研究人员将他们的新成果形容为“虚拟纳米显微镜”,研究人员将超过26,000张图像结合生成了近乎完整斑马鱼胚胎的十亿像素级电镜图像,分辨率达到了每英寸一千六百万像素。任何人都能使用JCB DataViewer将1.5毫米长斑马鱼胚胎的整体图放大到各亚细胞结构进行观察。该文章发表在八月六日的JCB杂志上。

  此外,研究人员还利用这一虚拟纳米显微镜分析了内皮细胞多糖复合物在肾小球滤过膜蛋白渗漏中的作用,对溶瘤呼肠孤病毒在人树突细胞中的内化进行了金标研究,并对完整的小鼠胚胎细胞进行了冷冻电镜研究。

  这一研究成果整合了跨细胞和组织的信息,将能为细胞生物学研究带来难得的机遇。由于这种大型图片很复杂,要获得Faas等人的研究数据必须要升级到JCB DataViewer。这是JCB发布于2008年的浏览器图像平台,旨在促进其发表文章中的原始数据分享。

  “实验中既然成像了,就应该要发表,”JCB主编Liz Williams说。作为一个杂志,“JCB将继续致力于开发前沿工具,以便将推动细胞生物学领域发展的数据呈现出来。”

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