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Cell子刊:单倍体干细胞加速基因功能分析

2014.1.10

  科学家们开发了全面鉴定基因功能的快速方法,这一技术能够大大增进我们对许多疾病的理解,例如心脏病、肝脏疾病和癌症等。

  该方法利用只含一组染色体的干细胞,为研究人员揭示了干细胞分化时发生的遗传学改变。研究指出,该方法还可以用来研究许多其他的生物学过程。

  胚胎干细胞通过特定的基因作用路径,保持自身的未分化状态,进行自我更新。如果干细胞退出这一路径,就会开始向其他细胞类型转变。不过,人们还不了解干细胞开始分化的具体机制。

  剑桥大学的研究人员开发了鉴定基因功能的新方法,并在此基础上鉴定了驱动细胞分化的重要因子。他们通过只含一组染色体的干细胞,揭开了细胞分化的机制。文章于一月九日发表在Cell Stem Cell杂志上。

  哺乳动物的细胞含有两组染色体,一组来自母亲,一组来自父亲。这成为了基因功能研究的一大挑战,因为每个细胞包含两个拷贝的基因,要确定遗传学改变与特定表型之间的关联,就特别的复杂。

  “传统方法只能一个个的分析基因功能,过去人们大多数时间都花在研究一个突变或一个基因上,”Dr Martin Leeb说,他与Austin Smith教授一同完成了这项新研究。“虽然现在这一过程有所加快,但本质上来讲还是在逐一分析基因的功能。要研究拥有两套染色体的生物,似乎只能这么做。”

  Dr Leeb使用无法受精的小鼠卵细胞,生成了只含有一组染色体的胚胎干细胞,即单倍体干细胞。研究显示,这些单倍体干细胞的特征与双倍体相同,也保持了同样的发育全能性,是在发育过程中研究基因作用路径的有力工具。

  研究人员利用转座子(跳跃基因),给几乎所有基因引入了突变。由于单倍体细胞只含一个基因拷贝,突变的效果可以立刻表现出来。此外,研究人员指出,单倍体干细胞可以帮助人们在任意细胞类型中研究遗传学突变。一旦发现了有重要生物学影响的突变,就可以通过二代测序确定发生突变的基因。

  “对于分析基因的作用路径来说,这是一个革命性的强大工具,”Dr Leeb说。“我们开发的细胞系和新方法,可以帮助人们解决大量的生物学问题。”

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