琥珀中不含有昆虫DNA 侏罗纪公园无法再现
英国曼彻斯特大学的研究人员近日在《PLOS One》上发表文章称，被困在琥珀前体中的昆虫不含有内源DNA。这一发现与之前的观点相悖。过去，人们声称可成功提取出DNA，并有望再造灭绝的动物。
在上世纪90年代，研究表明琥珀标本中的DNA可通过PCR而扩增，这一观点激发了许多人的想象。著名的科幻电影《侏罗纪公园》也由此产生。剧中科学家们利用琥珀中吸食恐龙血液的蚊子，最终克隆出恐龙，并建造一个侏罗纪公园。
然而，最近的研究对早期的成果提出了质疑，认为实际扩增出来的只是现代DNA污染物。
在这项研究中，曼彻斯特大学的Terry Brown教授及其同事转向新一代测序(NGS)技术，尝试检测昆虫标本中的DNA，他们认为这种方法受现代污染物的影响较小。
Brown 谈道：“PCR将优先扩增现代、完好的DNA分子，而这些分子可能污染了部分降解的古代DNA分子，带来假阳性结果。我们的新一代测序方法则适合古代DNA，因为它提供了所有DNA分子的序列，而无论多长，它也不太可能偏向现代分子。”
为了了解这种昆虫标本中是否含有DNA，Brown及其同事研究了两个无刺的蜜蜂(Trigonisca ameliae)，它们包裹在柯巴脂(copal)中，即琥珀的前体。一个样本约为60年，而另一个约为10,600年。
研究人员从树脂中取出样本，并进行测序的样本制备。每个样本都采用了非破坏性和破坏性的制备方法。之后，他们利用罗氏454的GS Junior系统进行了测序。
研究人员称，所有样本的read数量都很低。对于时间较近的标本，非破坏性制备方法产生了30个reads，平均读长为50个核苷酸，而破坏性制备方法产生了460个reads，平均读长为100个核苷酸。
Brown及其同事在数据库中搜索了这些reads，只找到有限的hits。对于时间较近的标本，非破坏性方法有2个，而破坏性方法有8个，但无一与无刺蜂相关。而来自时间久远标本的reads则似乎都是假象。
研究人员表示：“我们无法获得任何有说服力的证据，说明我们研究的这两个柯巴脂中保留了内源DNA。”
他们认为，阴性结果也不能完全归咎于技术的缺乏，因为他们已经从人体骨骼中成功分离并测序了古老的结核分枝杆菌DNA，以及考古植物样本中的DNA。同时也不能归咎于他们的提取和制备方法，因为这些方法已用于风干标本的DNA分离。
他们的结论是，无法获得序列reads是因为柯巴脂标本中不含有保存下来的DNA。文章的第一作者David Penney指出，“不幸的是，侏罗纪公园的场景只能停留在小说里”。
