第二代测序技术又称作深度测序技术，应用到RNA上统称作RNA-seq或RNA测序，它已成为基因表达和转录组分析的重要手段。第二代转录组测序数据中含有大量不编码蛋白质的ncRNA序列，因为它们像宇宙中的暗物质一样难以识别和有重要功能，也被称为“基因组暗物质”。由于数据量巨大，保守性差，又有噪音干扰，这些“暗物质”的识别成为表观遗传学和调控网络研究的瓶颈。piRNA是数量最大的一类ncRNA，主要是通过与转座子的序列互补来控制转座子的表达，进而调控生殖和发育。由于不同物种的piRNA之间同源性很差，至今国际上还没有有效的识别方法。

　　中国科学院动物研究所康乐研究组的张屹等最近发表的题为A k-mer scheme to predict piRNA and characterize locust piRNA 的最新研究论文，解决了高精度预测生物体中数量最大的一类非编码RNA---piRNA的难题，论文发表在生物信息学权威期刊《生物信息学》（Bioinformatics，IF=4.926）上。