新兴的CRISPR技术在短短一年多的时间内掀起了基因组编辑的热潮。然而,对于这些基因改造手段的效率和结果,我们仍难以评估。目前的一些工具如荧光报告基因、克隆分析,缺乏生成报告细胞系时所需的灵敏度。高通量测序方法虽然能克服这一问题,但无奈读长太短,而供体DNA模板往往很长。

  到目前为止,还没有一种测序平台能够同时评估非同源性末端接合(NHEJ)和同源介导修复(HDR)的发生频率,而这正是双链DNA断裂的两种主要修复机制。最近,单分子测序带来了一个好消息。研究人员证实,单分子实时(SMRT)测序技术能够同时测定任何位点的基因组编辑结果。这项研究成果发表在3月27日的《Cell
Reports》上。

  研究由斯坦福大学的Matthew
Porteus领导。研究人员在文中指出,这种方法可应用于各种基因组编辑平台,包括TALEN、CRISPR/Cas9和锌指核酸酶(ZFN),以确定理想的改造结果出现时的条件和策略。