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【讨论帖】成功过的战友讨论下,你曾经WESTERN...
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成功过的战友讨论下,你曾经WESTERN做不出来是那部分出问题了.看看各部分出问题的几率,为还没有成功,仍然苦苦寻找结果的战友提供点参考(由于本人经验有限,不足之处还请斑竹和各位大侠改正):
1、蛋白提取问题,蛋白降解,或者上样量少导致检测失败。
2、蛋白电泳失败。
3、转膜问题:转膜不充分,过转,温度过高导致蛋白结构改变等。
4、抗体问题。
5、显影问题。
6、其它。
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最新回复
loli (2013-10-17 17:43:35)
蛋白电泳第二,胶的配置,由于APS的失效,tris-Hcl PH不准,丙烯酰胺的氧化(以上问题一般都是配置时间较久以后)导致电泳失败或泳道奇形怪状。
uuooii (2013-10-17 17:43:53)
我认为western bloting 中蛋白提取是关键,最好用试剂盒提取,尤其目的蛋白是在亚细胞器表达的蛋白;其次是一抗二抗,一抗最好单克隆抗体,二抗国产好厂家的也行 ;ECL发光试剂一定要灵敏;制胶,电泳和转膜个实验室都做得比较常规了;显影定影按说明书作做活实验是经验就行。
89tongzijun (2013-10-17 17:44:30)
我做了很久的WB,最大的一个难点感觉在于样品制备上!蛋白的降解有些时候是你想象不到的,可能出奇的糟糕,也可能完全没事~~如果单独做WB的话,感觉以“快速彻底裂解,先变性后保存”的原则比较有效,尽量选择足够强的裂解液,甚至直接给loading buffer裂解,然后取出部分蛋白定量,其余加入loading buffer100度充分变性,再分装保存。有些时候比蛋白酶抑制剂更有效。
另一个感觉就是样品中目的蛋白的量,限于WB的检测下限问题,一般目的蛋白量最好别低于1ng(虽然ECL法下限是0.1ng,即100pg),最好在10ng以上为好。这就要求在做WB之前必须充分考虑目的蛋白的可能丰度,最好充分的准备工作然后再设计细胞量或者组织量,千万别把样品搞稀了,否则就不好办了。
最后,还是多看文献,在做某个蛋白之前最好看看别人是如何做的,有什么特殊要求,内参如何选等等。
zranqi_1 (2013-10-17 17:44:52)
summerxx (2013-10-17 17:45:12)
看到好几位战友都对蛋白制备有深刻的印象,也提醒我们正在WESTERN和准备WESTERN的战友,一定要注意过第一关,提出高质量的蛋白对实验成功至关重要!
希望更多的战友参与!
ha111 (2013-10-17 17:45:38)
楼上几位战友提出的蛋白制备确实非常重要,但如果在裂解液中加入cocktail的话应该不容易降解,-80度保存几个月都没有问题。
我认为western blotting 中最关键的一步是转膜。我的经验是小分子量的蛋白半干转效果比较好,大分子量(100KD)以上建议湿转。具体转膜条件需要多摸一下。30-80KD半干转恒流1mA/cm2,1-1.5h 都可以,大分子湿转100V,2.5h以上应该可以,转完膜丽春红染出的条带比较清楚的话,一般都能有结果。
抗体一般在其他问题排除后再考虑是否有质量问题。
moonlight45 (2013-10-17 17:46:00)
还有我转膜时一次转好几张,有的出来,有的出不来可能是什么原因?
谢谢了!
nut6694 (2013-10-17 17:46:30)
还有我转膜时一次转好几张,有的出来,有的出不来可能是什么原因?
谢谢了!
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战友,内参一般比较好做,能出来说明整个WB的流程应该没有问题,提的蛋白也可以,但是目的蛋白由于分子量大小不一样可能电泳和转膜条件也不一样,还有蛋白丰度问题导致蛋白量低出检测范围、抗体等环节都应该考虑。具体的问题可以把你详细的条件另辟新贴求助,祝出结果!谢谢!
mimili_901 (2013-10-17 17:46:53)
希望高手继续补充细节内容:)
am10 (2013-10-17 17:47:13)
1、跑胶 电泳Buffer重复利用的时候要注意,不能混浊,有时候能用个3-4次,有时候第二次都不行了,事先前预电泳一下,看看气泡的均匀度;Buffer一定要淹过梳子孔,否则就会发现今天的蛋白不会跑;跑的时候先用低电压跑过浓缩胶,再换高电压跑分离胶,不要追求速度,慢慢跑条带会分离的更好,特别是对于高分子量的目的蛋白;
2、转膜 我用的是湿转,Buffer一定要预冷,最好提前一天配好放4度;滤纸不要大过PVDF膜,防止短路;胶在负极,膜靠近正极,放入Tank前检查一遍会使你免以体会放反的痛心疾首;膜要标记好正反面;转膜过程中,经常过去看看,防止意外,如电泳仪接触不好。
就这些了,请各位指正
windy+++ (2013-10-17 17:47:43)
1、跑胶 电泳Buffer重复利用的时候要注意,不能混浊,有时候能用个3-4次,有时候第二次都不行了,事先前预电泳一下,看看气泡的均匀度;Buffer一定要淹过梳子孔,否则就会发现今天的蛋白不会跑;跑的时候先用低电压跑过浓缩胶,再换高电压跑分离胶,不要追求速度,慢慢跑条带会分离的更好,特别是对于高分子量的目的蛋白;
2、转膜 我用的是湿转,Buffer一定要预冷,最好提前一天配好放4度;滤纸不要大过PVDF膜,防止短路;胶在负极,膜靠近正极,放入Tank前检查一遍会使你免以体会放反的痛心疾首;膜要标记好正反面;转膜过程中,经常过去看看,防止意外,如电泳仪接触不好。
就这些了,请各位指正
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我的感觉是电泳跑胶时buffer的利用,如果蛋白跑出胶外,那下次一定就要更换,如果没有的话还能用一两次.
zranqi_1 (2013-10-17 17:48:36)
我是第一次作,作了3次,目前还没有成功。我发现跑胶的时候,有时候Marker会歪歪扭扭,转完膜(90V,4hr)后还有胶孔附近有残留,是不是没有转完全?另外,DAB染色和ECL那个好一点?如何操作?
盼各位大侠给个意见。
nut6694 (2013-10-17 17:48:53)
首先确定你的胶的浓度和离子强度没问题,如果胶不均匀Marker容易跑歪。转膜后看和你的蛋白分子量近似的预染Marker有没有转过去,如果marker没问题,那基本可以认为你的蛋白转过去了。显色的话应该ECL好些吧,灵敏度更高呢,HRP标记的二抗孵育完后用TBST充分清洗,然后加ECL试剂,包好后压片,一般如果你能够看到荧光的话,压片5min以内就可以看一下,如果看不见的话,直接压半小时吧。暗室仲压片,压片完后显影、定影、水洗,就可以了。
xue258 (2013-10-17 17:49:12)
做了几个月western了,总结下本人在western中遇见的一些问题:
听过一个讲座,说是在抗体中加叠氮钠,可以在4度保存,避免抗体的反复冻融。结果我就犯错误了,二抗也加叠氮钠了,导致发光显不出条带,找原因找了一周,才知道叠氮钠能抑制HRP的活性。
S6044 (2013-10-17 17:49:39)
我所纯化的蛋白为未知蛋白,目前仅知其具有甘露糖结合的活性和分子量,想用WB的方法鉴定纯化出的蛋白是否具有结合甘露糖的能力。在实验的过程中一直得不到理想的结果,有两个问题请各位高手指教:
1、不知在SDS-PAGE和WB的条件下,蛋白的糖结合活性是否可得以保存
2、因为蛋白是未知的,所以没有抗体可用,我们用一种带有甘露糖基的BSA来代替抗体,并用10nm胶体金与之耦联作为显色之用。10nm胶体金之前一直用于电镜观察,不知可否用于WB的显色。请各位各个意见。
JK.jon (2013-10-17 17:49:54)
我作WB,
第一次:SDS-PAGE电泳都没跑出来,怀疑是蛋白降解了,但是后来同样的样品和别人一起又跑一次,就跑出来了,发现是配胶的问题。分离胶要用12%的。
第二次:样品制备OK,浓度也测好了,电泳也跑得不错,PVDF膜不小心被手指划了一下,结果最后显影时候,显出来一个划痕。
第三次:我的B-actin做出来了,但是我的目的条带怎么也不出来,同样的条件,同样的过程,试剂也一样,我师姐的就做出来了,可见不是试剂的问题,显影同样用的DAB,这次考虑是抗体的问题了。
第四次:找公司换了抗体,果然ok了!
eric930 (2013-10-17 17:50:21)
(1)封闭不好。
(2) 一抗、二抗作用强度过高。
(3) 洗涤不充分。
对策包括:
a. 延长封闭时间;
b. 可调节一抗,二抗的稀释度,找到一个最佳浓度,使之能得到有效强度的信号,而非特异性的染色较低。
c. 充分洗涤,将未结合上的非特异性的抗体洗掉,可在缓冲液中加0.02-0.2%Tween20。
假阳性: 多数由抗体和有部分同源性的抗原间的交叉反应引起。主要解决办法是在保证阳性结果可见的前提下,尽可能高地提高抗体稀释度,使假阳性消失
mamamiya (2013-10-17 17:51:02)
我进实验室最先接触的就是WESTERN,我觉得首先要提出高质量的蛋白,然后一鼓作气往下做,不要放太久,即使-80度超过三个月结果也不太理想。新鲜的样品跑出来的条带很靓的。
实验室的温度对制胶很重要,气温过低会使凝胶不均匀,一、二抗也孵不上去,夏天的时候,不到8个小时就可以做完一个WESTERN,现在就不行了。
封闭液要保证有效。
一、二抗比例要适当,不然即使高浓度也没用。
转膜是个技术活,要耐心,但不是磨蹭。
化学发光试剂要好。
显影时间的控制和调整。
另外注意一些细小问题,比如缓冲液不要加错,上样要尽快,电泳时电压不要太高,洗膜要充分等,有时候往往会犯一些及其可笑的错误。
阿k (2013-10-17 17:51:24)
tudou85 (2013-10-17 17:51:43)
我最近一直在做,可是碰见一下问题向高手们请教,希望提点改正意见:
1 转膜时,多次出现小分子量的转膜效果不如中分子和大分子量的(用的彩虹MARKER,但14KD的亮黄色的条带仍然在胶上,转膜后的胶染色后小分子量区域的蛋白残留较多。在整张和将不同区域的分别转膜时均出现这种情况。)
2 在暗室里肉眼可以看见发光,可是胶片上一无所有。
3 ECL没有表达,可是用DAB时膜上却出现条带。
4 手工显影时,胶片的显影时间和温度有很大关系吗?显影的时间掌握如何比较恰当?
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