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Nature:巨型病毒也有类似细菌CRISPR的免疫系统

2016.3.07

  就像细菌,体型较大的病毒也需要保护自己,免受其他微小生物入侵。根据法国科学们的一项新研究,这些巨型病毒有类似于细菌中的CRISPR系统的免疫系统,来保护自己。相关工作发表在近期的《Nature》上。

  2003年,法国艾克斯-马赛大学的 Didier Raoult和Bernard La Scola发现在变形虫中存在奇怪的团块,后来被发现是一种典型的巨型病毒,比常见的病毒大了约四倍。因为这些病毒似乎可以模仿细菌,于是它们被称为mimiviruses。在随后的几年中,这些研究人员已经发现150不同类型的mimiviruses,如megaviruses和pandoraviruses。这些新类型病毒的出现挑战传统定义上的生物分类学。虽然争议仍然存在,Didier Raoult甚至声称mimiviruses可能是生命之树的一个新的分支。

  这些mimiviruses本身不同于其他病毒的表现为,它们自己可能被通过更小的病毒攻击。但在2014年,研究人员意识到,小型病毒只可以侵入某些类型mimiviruses。他们推测,有些mimiviruses病毒有很象细菌的免疫系统,它们可以将攻击者的少量DNA整合到自己的遗传物质中。这样,如果在同一病毒试图再次侵入,宿主mimiviruses病毒能够识别出该攻击者,并清除它。

  研究人员想检测这些mimiviruses病毒,看看他们是否也有一个类似于CRISPR的免疫系统。因此,他们分析了60株不同的mimiviruses病毒。研究人员发现,可以入侵这些mimiviruses的更小号病毒Zamilon的DNA的片段可以在mimiviruses基因组中被发现,而且mimiviruses病毒对于入侵者Zamilon有了免疫力。研究人员还发现,mimiviruses病毒含有能够降解外源DNA的酶,就像细菌中的CRISP中的酶一样。研究者将此病毒的免疫系统命名为MIMIVIRE,它代表“巨型病毒噬菌体抑制元件”。

  该MIMIVIRE可能和细菌中的CRISPR有完全不同的工作原理,这或许是趋同进化的一个很好的例子。但该研究确实提供了很多的证据来表明,mimiviruses不同于其他更简单的病毒,从而将病毒的进化起源问题的讨论转移到病毒究竟是不是“活着的生物”的讨论。今后,研究人员希望更好地了解驱动MIMIVIRE的分子机制。

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