梭菌(Clostridium)是一类与人类关系非常密切的细菌。其中既有许多致病菌，如产生外毒素的破伤风梭菌和肉毒梭菌等；也有一些具有重要工业应用价值或潜力的梭菌，如丙酮丁醇梭菌和热纤梭菌等。
基因失活或基因删除是细菌功能基因组学研究的基本手段。近年来，基于乳酸乳球菌II型内含子剪切机制开发的梭菌内含子系统，显著提高了梭菌基因插入失活的效率。但若要在梭菌中通过双交换同源重组来删除基因，仍然非常困难，鲜有成功案例。
中科院微生物研究所的贾开志博士与其合作导师李寅研究员受到II型内含子可高效插入梭菌基因组的启发，设计了一个将逆转录转座与同源重组结合起来的基因删除策略。这一策略的第一步是在II型内含子的下游引入与拟删除基因上游同源的一段序列（简称为同源序列）；第二步是通过逆转录转座作用，将携带有同源序列的II型内含子插入梭菌基因组；第三步是筛选单交换同源重组的基因型，获得目标基因、操纵元或基因簇得以删除的突变株。